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发菜耐旱相关蛋白NXL-01的基因克隆与表达分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] Q786[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]宁夏大学生命科学学院,银川750021, [2]福建农林大学生命科学学院,福州350002
  • 相关基金:国家自然科学基金(31360054;31060038)
中文摘要:

在发菜耐旱差异蛋白质组学研究中,发现假定蛋白(Hypothetical protein NXL-01)在干旱胁迫条件下表达量逐渐增加。根据已知氨基酸序列设计简并引物克隆NXL-01基因,长度为327bp(GenBank登录号为HM854288)。生物信息学分析表明,该基因具有较高保守性,蛋白质二级结构主要由α螺旋和随机卷曲构成,是亲水性的膜外蛋白,有5个Ser磷酸化位点,1个Thr磷酸化位点。将NXL-01基因在大肠杆菌中表达,获得预期大小的重组蛋白(12.4kD)。RT-PCR分析表明,NXL-01mRNA在干旱胁迫条件下表达量逐渐增加,与NXL-01蛋白的表达趋势一致。

英文摘要:

Nostoc flagelliforme is a kind of terrestrial nitrogen-fixing cyanobacteria being strong drought ecologieal adaptability. An unknown protein related to drought-tolerant, named hypothetical protein NXL- 01,has been discovered by the proteornic analysis under drought stress. NXL-O1 gene was cloned by designed degeneracy primers based on identified amino acid sequences. A full length of 327 bp DNA was obtained(GenBank access number: HM854288). Bioinformatics analysis showed that the NXL-01 gene was highly conservative. The secondary structure of NXL-01 was made up of a helix and random eoil. It was a hydrophilic outside membrane protein with five Ser phosphorylation sites and one Thr phosphorylation site. NXL-O1 was expressed in E. coli,and a 12.4 kD heterologous protein was observed. RT-PCR showed that mRNA level of NXL-01 gradually increased, consistent with the expression trend of NXL-01 in N. flagelliforme under drought stress.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104