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基于超滤膜辅助的糖蛋白全O-连接糖链的富集和MALDI-TOF/TOF质谱结构解析
  • ISSN号:1000-3282
  • 期刊名称:《生物化学与生物物理进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q81[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]江南大学糖化学与生物技术教育部重点实验室,无锡214122, [2]第二军医大学生物化学与分子生物学教研室,上海200433
  • 相关基金:国家自然科学基金青年科学基金(81402115),国家高技术研究发展计划(863)(2014AA093513)和江苏省自然科学基金(BK20140172)资助项目.
中文摘要:

哺乳动物中约有50%以上的蛋白质都发生了糖基化修饰.连接在丝氨酸或苏氨酸上的O-连接糖链是常见的蛋白质糖基化修饰方式之一,其主要功能是维持与其连接的蛋白质部分的空间构象,保护其免受蛋白酶水解及覆盖某些抗原决定簇.糖链结构的解析有助于更清楚地认识糖蛋白及其功能.本研究建立了一种基于超滤膜辅助(FASP)富集细胞、血清和尿液中糖蛋白全β连接糖链的方法,根据糖蛋白与其糖链结构之间的分子质量差异,利用10KD超滤膜富集蛋白质样品中由β消除反应释放的全O-连接糖链,将糖链甲基化修饰后再使用MALDI-TOF/TOF-MS进行解析,同时利用二级质谱进行结构确认.通过上述方法可从标准糖蛋白mucin、细胞、血清和尿液样本中分别鉴定到83、29、33和85种O-连接糖链结构,利用该方法可以从复杂样品中富集和解析糖蛋白全O-连接糖链,实现快速、高效、高通量地解析糖蛋白O-连接糖链的目的.

英文摘要:

Approximately more than half of mammalian proteins are glycosylated. O-linked glycan, attached to protein via serine or threonine residue, is one of common post-translation modifications on proteins. Its main functions include maintaining the conformation of the protein connected, protecting it from proteolysis, and covering some antigenic determinant. Analysis of O-linked glycan structure of glycoproteins can contribute to a clearer understanding of glycoproteins and their functions. This study describes a new strategy, involving enrichment and separation of total O-glycan from the glycoproteins based on a filter assisted sample preparation method (O-glycan-FASP), which was developed using ultrafiltration units according to the molecular mass differences among the glycans and proteins. The glycans were characterized and confirmed by MALDI-TOF/TOF-MS. A total of 105, 29, 33 and 85 distinctive O-glycan were characterized from bovine submaxillary mucin (BSM), human cell, serum and urine respectively.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生物物理研究所 中国生物物理学会
  • 主编:王大成
  • 地址:北京市朝阳区大屯路15号
  • 邮编:100101
  • 邮箱:prog@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888459
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3282
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2161/Q
  • 邮发代号:2-816
  • 获奖情况:
  • 1999年中国期刊奖提名奖,2000年中国科学院优秀期刊特别奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18821