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应用基因芯片检测系统性红斑狼疮患者外周血B淋巴细胞
  • ISSN号:1007-7480
  • 期刊名称:中华风湿病学杂志
  • 时间:0
  • 页码:664-667
  • 语言:中文
  • 分类:R758.62[医药卫生—皮肤病学与性病学;医药卫生—临床医学] R742.1[医药卫生—神经病学与精神病学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]南京大学医学院免疫与生殖生物学实验室,210093, [2]南京大学医学院附属鼓楼医院风湿免疫科, [3]江苏省医学分子重点实验室
  • 相关基金:国家自然科学基金(30771959);汀苏省自然科学基金(2006119)
  • 相关项目:雌激素通过MCM6调控树突状细胞功能及其TLR9信号转导的机制研究
中文摘要:

目的应用寡聚核苷酸基因表达芯片研究系统性红斑狼疮(SLE)患者与健康志愿者外周血B淋巴细胞基因表达谱的变化。方法应用包含21522条70mer长度Oligo DNA的寡聚核苷酸芯片(22K Human Genome Arrav)分别检测6例SLE患者和6名健康志愿者外周血B淋巴细胞基因表达谱,应用聚类分析法分析差异表达的基因。结果SLE患者外周血B淋巴细胞和健康志愿者B淋巴细胞之间基因表达谱有显著差异,芯片中聚类表达显著上调的基因15个,主要包括Ⅰ型干扰素(IFN)通路中的相关分子;聚类表达显著下调的基因22个,主要包括神经内分泌相关的精氨酸甲基化转移酶家族等与雌激素代谢相关的基因。进一步对这些差异表达基因进行了初步的功能分类分析,分析结果表明这些基因主要与B淋巴细胞的JAK—STAT信号通路和激素代谢相关。结论SLE患者外周血B淋巴细胞基因表达谱存在显著差异,芯片显示氨基酸代谢、激素代谢、细胞增殖和凋亡、炎症反应等相关生物学功能的改变可能参与SLE的发病。

英文摘要:

Objective To identify the differentially expressed genes in systemic lupus erythematosus (SLE) by comparing the gene expression profile of peripheral blood B cells between SLE patients and healthy controls. Methods The total RNAs were extracted from B cells of SLE patients and normal subjects, the cDNA retro-transcribed from equal quantity mRNA were labeled with Cy3 and Cy5 fluorescence as probes. Analysis of the differentially expressed genes was carried out by hierarchical cluster method. Results Clustering analysis showed that 15 genes were up-regulated, mainly including the type Ⅰ IFN related genes. Twenty-two genes were down-regulated, mainly including estradiol metabolism related genes. While these genes were classified initially according to their functions, it was found that they played important role mainly in JAK-STAT pathway. Conclusion Significant differences are found in the expression of some functional genes in the B cells between SLE patients and healthy controls. Most of these genes are involved in amino acid metabolism, hormone metabolism, cell proliferation and apoptosis.

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期刊信息
  • 《中华风湿病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:山西省太原市东华门23号
  • 邮编:030013
  • 邮箱:cmafsb@163.com
  • 电话:0351-7553295 7553182
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7480
  • 国内统一刊号:ISSN:14-1217/R
  • 邮发代号:22-153
  • 获奖情况:
  • 1998年,《中华风湿病学杂志》社被共青团省委、山...,1999年获山西省第二届书刊装帧艺术作品一等奖,1999—2002年被评为山西省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16745