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兰州大尾羊心脏型脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因克隆及其同源性比较
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S826[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]西北民族大学实验中心,兰州730030, [2]西北民族大学生命科学与工程学院,兰州730030
  • 相关基金:国家自然科学基金(31160440,31260533)、甘肃省科技支撑计划项目(1011NKCA051)、甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW-2009-13)、国家民委科研项目(2009-158.09XB02)、兰州市科技计划项目(2011-1-113)
中文摘要:

【目的】克隆兰州大尾羊心脏型肪酸结合蛋白(H-FABP)基因全长cDNA序列,为研究绵羊H-FABP生物学作用和生产应用提供理论依据。【方法】根据已知哺乳动物H-FABP基因cDNA序列,设计5'和3'特异引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得兰州大尾羊H-FABP基因全长cDNA序列。【结果】扩增获得兰州大尾羊5'端425 bp、3'端231 bp片段和177 bp中间片段,拼接获得748 bp兰州大尾羊H-FABP基因全长cDNA序列(GenBank登录号:JQ780322)。兰州大尾羊H-FABP基因ORF长402 bp,编码133个氨基酸。核苷酸序列分析显示兰州大尾羊H-FABP基因序列与大多数哺乳动物相似,但其第66位发生的碱基转换(T←→G)引起所编码的第22位天门冬氨酸(N)不同于其它所有物种的赖氨酸(K)。构建的基因进化树分析结果显示兰州大尾羊与山羊亲缘关系最近。预测兰州大尾羊H-FABP蛋白质的空间结构与山羊和牛H-FABP类似,由2个α螺旋和10个反向平行的β折叠组成,10个折叠片围成一个桶状结构,疏水性残基位于桶内,用于结合脂肪酸。【结论】克隆了兰州大尾羊H-FABP基因,为进一步研究该基因的功能奠定了基础。

英文摘要:

[Objective] To clone the full length cDNA of heart fatty acid-binding protein (H-FABP) gene in Lanzhou fat-tailed sheep for providing a theoretical basis to study its biological function and application in sheep. [Method] The 5'- and 3'- gene specific primers were designed according to the alignment of known eDNA sequences of H-FABP from mammals. Technique of rapid amplification of eDNA ends (RACE) was employed to clone the full length cDNA ofH-FABP gene in Lanzhou fat-tailed sheep [ Results ] About 425 bp 5'-RACE eDNA and 231 bp 3'-RACE eDNA was obtained by 5'-RACE and 3'-RACE, respectively, using skeletal muscle RNA transcribed eDNA as template. Nest PCR was performed to clone 177 bp intermediate fragment. The fall length eDNA of 748 bp H-FABP gene was spliced (GenBank Accession Number JQ780322). The open reading frame of sheep H-FABP gene is 402 bp in length, encoding a mature protein H-FABP of 133 amino acids and a resulting Mr=14 761. Phylogenetic analysis showed that H-FABP gene in Lanzhou fat-tailed sheep is more close to goat, Capra hircus. Alignment comparison indicated that nucleotide homology of H-FABP gene in sheep is more similar with mammals. However, the base transition from T to G in sixty-six of nucleotide sequence leading to the change from asparagines (N) to lysine (K) in twenty-second of amino acid sequence, which is different from other species. It is predicted that tertiary structure of H-FABP protein is very similar to H-FABP of C. hircus, having α-helix, 10 antiparallel β-pleated sheets that form barrel. [Conclusion] The full length cDNA of 748 bp H-FABP gene was first to be cloned by RACE. This finding may provide basic data for further studying the role of H-FABP gene in sheep.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620