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5-HT3受体拮抗剂药效团模型的构建
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O629[理学—有机化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]北京中医药大学中药学院,北京100102
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:30472180)和国家“九七三”计划(批准号:2005CB523401,2006CB504703)资助.
中文摘要:

以31个来源于MDDR数据库中具有抑制鼠Bezold-Jarisch反射作用的5-HT3受体拮抗剂作为训练集化合物,构建5-HT3受体拮抗剂药效团模型.训练集化合物具备结构多样性,来源于相同药理模型,活性值ED50范围为0.05~320μg/kgi.v..利用Catalyst计算5-HT3受体拮抗剂的最优药效团由一个氢键受体、一个疏水基团、一个正电离子化基团、一个芳香环特征和6个排除体积组成;Fixedcost值、Nullcost值、Δcost值和Configurationcost值分别为112.6,172.0,59.4和7.248.训练集化合物活性的计算值与实测值相关系数为0.9031,偏差值为0.8976,基于Fischer的交叉验证结果表明药效团模型具有较高的置信度,所得药效团对训练集化合物活性值的预测结果显示有较好的预测能力,可用于数据库搜索指导发现新的具有该活性的先导化合物,也可用于中药或天然产物药物研究开发.

英文摘要:

A three-dimensional pharmacophore model of 5-HT3 Receptor Antagonists was developed based on 31 5-HT3 Receptor Antagonists which antagonizes the von Bezold-Jarisch reflex evoked by 5-HT in anesthetized rats. The antagonists were selected with great diversity in both molecular structure and bioactivity as required by HypoGen program in the Catalyst software. The antagonists in training set show 5-HT3 Receptor inhibiting activity with ED50 values, and the range of values is 0. 05-320 μg/kg i. v.. The best statistical hypothesis, consisting of four features, one hydrogen-bond acceptor, one hydrophobic region, one ring aromatic feature, one positive ionizable and six excluded volumes, has a correlation coefficient of 0. 9031, a root-mean-square deviation of 0.8976, a fixed cost of 112. 6, a null cost of 172. 0, a configuration cost of 7. 248. The pharmacophore model has a highly predictive ability, which was approved by the results of the activity estimated by mapping the compounds of training set with it. On the basis of Fischer method, the cross-validation provided a strong confidence on this hypothesis. This pharmacophore model can contribute to the finding and designing of new-type 5-HT3 Receptor Antagonists.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676