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中华蜜蜂普通气味结合蛋白ASP2的气味结合功能模式分析
  • ISSN号:0578-1752
  • 期刊名称:《中国农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S893.2[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国计量学院生命科学学院/浙江省生物计量及检验检疫技术重点实验室,杭州310018
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30900163); 浙江省自然科学基金项目(Y307597)
中文摘要:

【目的】研究中华蜜蜂(Apis cerana cerana)体外重组普通气味结合蛋白AcerASP2与不同气味信息的结合功能和模式。【方法】通过诱导条件的优化和纯化,在获得的重组AcerASP2蛋白基础上,研究竞争性荧光探针1-NPN及不同结构气味信息与蛋白的相互作用关系,并通过同源建模和分子对接解析蛋白与气味信息的结合模式和机理。【结果】通过条件摸索获得了可溶性表达的重组中蜂ASP2蛋白,荧光光谱分析1-NPN与AcerASP2的解离常数K1-NPN为7.38μmol.L^-1,结合位点数n为1.0321。在7种气味信息中,4-烯丙基藜芦醚亲和力最强,其IC50和解离常数KD分别达到7.09和3.46μmol.L^-1。分子对接显示AcerASP2具有1个呈狭长的口袋状的疏水性结合内腔,4-烯丙基藜芦醚绝大部分位于该预测疏水性内腔中,且与Lys74产生2个氢键。【结论】中华蜜蜂AcerASP2由于特殊的空间结构而具有较强的气味信息结合能力,且易通过与疏水内腔中的赖氨酸残基产生氢键而促进结合。

英文摘要:

[ Objective ] The objective of this study is to research the binding function and mode of different odors with general odorant binding protein AcerASP2 of Chinese honeybees'(Apis cerana cerana). [Method] With the optimization of induction conditions, the purified recombinant AcerASP2 protein was obtained, then the competitive fluorescence assay was used to determine the binding function of AcerASP2 with odors having different structures, finally the homology modeling and molecular docking were applied to elucidate the binding mode and mechanism. [Result] After the soluble recombinant AcerASP2 protein purified, in the competitive fluorescence assay between AcerASP2 and 1-NPN, the dissociation constants K1-NPN and the number of binding sites n were 7.38 μmol-L^-1 and 1.0321, respectively. In selective 7 kinds of odors, the affinity of 4-allylveratrole seemed to be the strongest, and the ICs0 and dissociation constant KD were 7.09 and 3.46 μmol.L^-1, respectively. The molecular docking results showed that AcerASP2 had one elongated pocket-like hydrophobic cavity, 4-allylveratrole just existed in the cavity, and two hydrogen bonds were found with Lys74 of AcerASP2. [ Conclusion ] Because of the particular spatial structure of binding cavity, AcerASP2 could bind diverse odors with different structures, and the binding interaction could be easily to be promoted by the hydrogen bonds between odors with lysines in AcerASP2.

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期刊信息
  • 《中国农业科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院 中国农学会
  • 主编:万建民
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农业科学院图书馆楼4101-4103室
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zgnykx@caas.cn
  • 电话:010-82109808 82106279
  • 国际标准刊号:ISSN:0578-1752
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1328/S
  • 邮发代号:2-138
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵“双高”期刊,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:85620