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鱼类谷胱甘肽转移酶基因cDNA克隆及其序列分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华中农业大学水产学院,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,武汉430070, [2]中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉430072
  • 相关基金:国家自然科学基金(编号:30530170),华中农业大学科研启动基金(编号:52204-04031)以及华中农业大学大学生科技创新基金资助
中文摘要:

采用RT-PCR方法,从鲢、鲤、鲫3种鱼类肝脏总RNA中克隆出了谷胱甘肽转移酶Pi型(GSTPi)cDNA序列,推导了其编码的氨基酸序列。3种鱼类GSTPi的ORF全长627bp,编码208个氨基酸。翻译起始密码均为ATG,终止密码子均为TGA。鱼类与哺乳动物、两栖类爪蟾以及节肢动物丝虫之间GSTPi氨基酸序列相似度平均值分别为50%、33%、15%左右。5种鱼类之间的氨基酸序列相似度较大,其中鲤科鱼类之间平均为85%左右。我们以GSTPi为分子标记,用最大简约数法(MP)构建了13个物种的系统进化树,识别出两个大的单系类群:哺乳类组成类群一(bootstrap 100);鱼类组成类群-(bootstrap 93)。通过比较鱼类与哺乳类GSTPiN末端和c末端功能域的氨基酸组成差异,探讨了淡水鱼类GSTs承担较强的微囊藻毒素去毒能力的可能分子机制。

英文摘要:

Using RT-PCR method, the glutathione transferase Pi cDNAs were cloned from Cyprinus carpio, Hypophthalmichthys molitrix, and Carassius auratus. The open reading frames (ORFs) from the 3 fishes were 627 bp long (encoding for 208 amino acids) with the initial code ATG and the terminal code TGA. The sequence similarity was 50% between fish and mammals, 33% between fish and amphibian, and 15% between fish and arthropoda, respectively. The sequence similarity was big among fishes, and the average value of the 4 cyprinids was about 85%. Phylogenetic tree was constructed for 13 species based on GST Pi amino acid sequences using MP (Maximum Parsimony) method. Two major clusters were recognized: cluster one consisted of Mammals (bootstrap 100) and cluster two consisted of fishes (bootstrap 93). Based on the sequences analyses of N/C domain of GST Pi, we proposed the detoxification mechanism of freshwater fishes that were thought to have stronger tolerance to microcystins.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270