位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测
  • ISSN号:1007-0435
  • 期刊名称:《草地学报》
  • 时间:0
  • 分类:S543.9[农业科学—作物学] Q943.2[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学林学与风景园林学院,广东广州510642, [2]广东省草业工程技术研究中心,广东广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金(31272491,30972138); 教育部高等学校博士学科点专项科研基金(20124404110011)资助
中文摘要:

苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物木质素生物合成途径中的关键酶,参与木质素、类黄酮和花青素等次生代谢产物的形成。本研究以‘N51’象草(Pennisetum purpureum)为材料,通过同源克隆、3′RACE和hi-Tail PCR的方法,对PAL基因进行克隆,得到PpPALcDNA序列2429bp以及DNA序列全长3907bp。PpPAL编码的蛋白包含720个氨基酸,具有典型的GTITASGDLVPLSYIAG苯丙氨酸解氨酶保守活性基序。运用生物信息学进行分析,PpPAL基因cDNA序列与玉米(Zea mays L.)ZmPAL的相似性最高为94%,与其他禾本科植物也有着较高的相似性。在氨基酸序列系统进化分析中,PpPAL与ZmPAL遗传距离最近,并与其他禾本科植物PAL聚为一类。PpPAL蛋白的三维结构模型显示,PpPAL蛋白具有典型的"海马状"结构,表明PpPAL是典型的苯丙氨酸解氨酶家族,对木质素的合成起着重要的作用。

英文摘要:

Phenylalanine ammonia-lyase(PAL)is a key enzyme involved in lignin biosynthesis.It catalyzes the first step of phenylpropanoid pathway,which supplies precursors for a variety of secondary metabolites including phenolics,flavonoids and anthocyanin.In this study we isolated a PALgene fromPennisetum purpureumcv.N51 using homology cloning and RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)methods as well as hi-Tail PCR.The length of PpPALcDNA sequence was 2429 bp.The nucleotide sequence of PpPALgene was 3907 bp long and high similarity to ZmPAL,with 94%identity.The PpPALgene encoded a 720-amino-acid protein,which contained a conserved motif of GTITASGDLVPLSYIAG.In phylogenetic tree,the PpPALhad a close genetic distance with ZmPAL,and was clustered in the same group with other gramineous plants involved in lignin biosynthesis.By predicting,the three-dimensional structure of the PpPALprotein showed a typical "sea horse" shape,which indicated that PpPALis a typical family member of phenylalanine ammonia-lyase,should play an important role in lignin synthesis.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《草地学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国草原学会
  • 主编:王堃
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农业大学动科楼152室
  • 邮编:100193
  • 邮箱:cdxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733894 62732799
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-0435
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3362/S
  • 邮发代号:80-135
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13756