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一个植物乳杆菌隐蔽质粒的序列分析
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:《生物技术》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.117[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]成都医学院病原生物学教研室,四川成都610500, [2]成都医学院公共卫生系,四川成都610500
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(“快速检出中国传统泡菜中的乳杆菌并鉴定其中的新种和新质粒”,No.31170007); 四川省教育厅科技基金重点项目(“分离鉴定大熊猫粪便中的乳杆菌并测定其纤维素酶基因功能”,No.14ZA0219)
中文摘要:

[目的]分离植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum LP101)中的质粒,并对其序列进行分析。[方法]从植物乳杆菌LP101中提取质粒并行双酶切,纯化后与载体pet22b进行连接,电转化到大肠杆菌DH5α中。将测序后得到的质粒片段进行拼接,对拼接成功的质粒进行序列分析。[结果]从植物乳杆菌LP101中分离得到一个隐蔽质粒p LP101,测序结果显示该质粒大小为3 496 bp,碱基G+C含量为38.2%,编码了一个移动蛋白和一个复制蛋白。BLAST结果显示该质粒的核苷酸序列与干酪乳杆菌(L.casei)中的质粒p SMA23相似性在99%以上。[结论]分离得到了植物乳杆菌LP101中的一个隐蔽质粒p LP101,推定其复制方式为滾环复制,属于滚环复制p C194家族成员。

英文摘要:

[Objective]Isolation and sequence of plasmid from Lactobacillus plantarum LP101. [Methods]Plasmids were extracted from L. plantarum LP101 and determined by double digestion. The purified plasmids and pet22 b vector were ligated and transformed into host strain Escherichia coli DH5α. Fragments were spliced and analyzed after gene sequencing. [Results]A cryptic plasmid isolated from L. plantarum LP101 was sequenced and characterized. The plasmid p LP101 is a 3 496 bp circular molecule with a G + C content of 38. 2%. Sequence analysis indicated that ORF1 was predicted to encode a mobilisation( Mob) protein,and ORF2 encode a replication initiation( Rep). The result of BLAST showed that p LP101 shared more than99% DNA sequence identity with plasmid p LC88. [Conclusion]A cryptic plasmid has isolated from L. Plantarum LP101. According to the analysis of Rep,dso and sso,it suggested that plasmid p LP101 belongs to p C194 rolling- circle family.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
  • 邮编:150010
  • 邮箱:swjszz@163.com
  • 电话:0451-84615121
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503