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一种蛋白质三维结构中残基重心的计算方法
  • ISSN号:1005-9164
  • 期刊名称:广西科学
  • 时间:2013.3.3
  • 页码:132-136
  • 分类:TP312[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术] Q816[生物学—生物工程]
  • 作者机构:[1]广西大学数学与信息科学学院,广西南宁530004, [2]广西科学院,广西南宁530007, [3]广西大学生命科学与技术学院,广西南宁530004
  • 相关基金:国家973项目(2009CB724703);国家自然科学基金项目(31060125)资助.
  • 相关项目:蔗糖磷酸化酶转糖苷反应中与受体特异性相关的氨基酸残基的研究
中文摘要:

基于蛋白质三维结构数据PDB,给出一种蛋白质残基重心的计算方法,同时阐述该方法的python语言的实现过程.该方法不需要知道残基侧链原子的坐标,只需知道主链上原子的坐标即可计算蛋白质残基间的距离.

英文摘要:

In some applications such as protein structure prediction or molecular docking, distances between pairs of residues play an important role. Actually, this distances are those between pairs of residue centroids. This paper describes in detail an algorithm of how to calculate the residue centroids and its implement with python programming language.

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期刊信息
  • 《广西科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:广西科学技术厅
  • 主办单位:广西科学院 广西壮族自治区科学技术协会
  • 主编:罗海鹏
  • 地址:广西南宁市大岭路98号
  • 邮编:530007
  • 邮箱:gxkxbjb@gmail.com
  • 电话:0771-2503923 2503922
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-9164
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1206/G3
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双效期刊,广西第四届十佳科技期刊,广西第二、三届优秀科技期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:4882