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辽宁绒山羊UMP/CMP激酶基因的表达及分析
  • ISSN号:2095-3887
  • 期刊名称:中国草食动物科学
  • 时间:2013.2.1
  • 页码:10-14
  • 分类:S827.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]辽宁师范大学生命科学学院,辽宁省生物技术与分子药物研发重点实验室,大连116029
  • 相关基金:国家“十一五”科技支撑计划(2009BADA5801) 国家自然科学基金(30972079);大连市科技计划项目(2010Bi4NC104).辽宁省百千万人才基金
  • 相关项目:辽宁新品系绒山羊新基因K26和KAP26.1功能和作用机制的研究
中文摘要:

在前期构建辽宁绒山羊皮肤cDNA文库的基础上,测通得到了新基因UMP/CMP激酶的全长序列,并对UMP/CMP激酶基因进行生物信息学分析。然后,通过RT—PCR检测该基因在心、肝、脾、肺及肾中的表达。生物信息学分析显示,UMP/CMP激酶基因全长1081bp,能够编码含有228个氨基酸的蛋白质,亮氨酸、甘氨酸、赖氨酸含量较高。UMP/CMP激酶含有较高比例的无规卷曲结构(51.75%),并发现其含有UMP/CMP激酶蛋白结构域。蛋白三级结构、进化树分析显示,辽宁绒山羊和牛的UMP/CMP激酶基因的同源性最高。UMP/CMP激酶基因存在跨膜结构域,并且存在信号肽剪切位点。该基因中有8个Ser,2个Thr,2个Tvr可能成为蛋白激酶磷酸化位点。RT—PCR检测显示,UMP/CMP激酶基因特异地表达于皮肤。这些研究结果为深入研究辽宁绒山羊的种质遗传特性奠定了基础。

英文摘要:

In order to study the genetic characteristics of Liaoning newbreed cashmere goat,on the basis of construction of a skin cDNA library and isolation of a full-length cDNA clone termed UMP/CMPK,the bioinformatics analysis and semi- quantitative RT-PCR were used to detect the expression of the UMP/CMPK gene in all internal organs. A bioinformatics analysis showed that the UMP/CMPK gene encoded a putative 228 amino acid protein that exhibited a high content of leucine, glycine and lysine and had a lower content of histidine and tryptophan. The secondary structure prediction revealed a high proportion of random coils (51.75%). UMP/CMPK contained a conservative UMP/CMP kinase protein structure domain. UMP/CMPK of the goat and cattle had the highest homology. UMP/CMPK also had transmembrane domain and signal peptide. 8 Ser,2 Thr and 2 Tyr may be phosphorylation sites in CMP/UMPK protein.RT-PCR analysis showed that UMP/ CMPK were only present in goat skin. This research provides an experimental basis for the further study of the genetic characteristics of the goat.

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期刊信息
  • 《中国草食动物科学》
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所
  • 主编:阎萍
  • 地址:兰州市七里河区硷沟沿335号
  • 邮编:730050
  • 邮箱:xumuchj@163.com
  • 电话:0931-2115279
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-3887
  • 国内统一刊号:ISSN:62-1206/Q
  • 邮发代号:54-57
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,2002年度全国农业优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版)
  • 被引量:788