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微阵列图像降噪和自动定位
  • ISSN号:1673-9965
  • 期刊名称:《西安工业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:TN911.73[电子电信—通信与信息系统;电子电信—信息与通信工程]
  • 作者机构:[1]西北工业大学电子信息学院,西安710072
  • 相关基金:国家自然科学基金(60672184)
中文摘要:

针对基因芯片实验中存在的数据处理效率低、数据分析质量差等问题.将一种新的小波降噪技术和自动样点定位方法用于cDNA微阵列图像处理.研究表明:基于小波分解的降噪方法,对微阵列图像的噪声滤除非常有效,平均峰值信噪比可达到65dB.利用一种允许高吞吐量分析的全自动划格方法,对微阵列图像进行自动定位,对于基因表达微阵列图像精度可达到97%.

英文摘要:

There are many factors which could cause error in microarray experiment. These could result in difference between ideal image and actual image. The efficiency of the manual-gridding method is low and the quality is not very good. In this paper, a microarray image enhancement of cDNA microarray images using a novel wavelets denoising technique and automatic addressing is presented. This study shows that robust denoising, based on wavelet decomposition and spot detection, can be used successfully to remove the noise from microarray images. The CPSNR is on the verge of 65dB. In addition, this paper introduces a fully automatic gridding method which permits a high throughput analysis, taking into account the subarray alignment problem. The method has the 97 percent accurate rate to effectively detect the grids on microarrays images of gene expression profiles.

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期刊信息
  • 《西安工业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:陕西省教育厅
  • 主办单位:西安工业大学
  • 主编:雷亚萍
  • 地址:西安市未央大学园区学府中路2号
  • 邮编:710021
  • 邮箱:
  • 电话:029-86173236
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-9965
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1458/N
  • 邮发代号:52-261
  • 获奖情况:
  • 陕西省教委、省新闻出版局优秀期刊,教育部优秀高校学报
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:2140