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海洋链霉菌Streptomyces sp.B-17卤化酶基因的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1005-7021
  • 期刊名称:《微生物学杂志》
  • 分类:Q93[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]大连工业大学生物工程学院,辽宁大连116034
  • 相关基金:2013年国家、辽宁省暨大连工业大学大学生创新创业训练计划项目(2013092)
中文摘要:

海洋放线菌是生理活性物质重要的产生菌,而海洋放线菌产生的卤化酶可催化生理活性物质的卤化,极大提高了其抑菌和抗癌活性。从大连海域分离出1株链霉菌Streptomyces sp.B-17,从其基因组DNA中扩增一524 bp的基因片段,经与pMD-19T载体连接,转化大肠埃希菌JM109感受态细胞,重组质粒经鉴定证明正向插入到pMD-19T载体。生物信息学分析表明该序列与Actinocorallia herbida DSM 44252的2个依赖FADH2卤化酶基因的同源性为88%,拟编码氨基酸与色氨酸卤化酶(CP001848)的相似性也达到74%,证明所克隆的基因片段为卤化酶基因片段,为后续的基因功能分析及表达奠定了基础。

英文摘要:

Marine actinomycetes(MA) are important sources of physiological active substances(PAS),halogenase produced by the MA can catalyze the halogenization of the PAS,which greatly increased its antimicrobial and anticancer activities.A Streptomyces sp.B-17 strain was isolated from Dalian sea area,in this article a 524 bp gene fragment was amplified from its genomic DNA,after it was linked with pMD-19T vector and transferred into E.coli JM109 competence cell,the recombinant plasmid was identified and proved that it had been inserted in positive direction into pMD-19T vector.Bioinformatics analysis showed that the homology of the sequence of the cloned DNA fragment with two FADH2-dependent halogenase genes of Actinocorallia herbida DSM 44252 sequence was 88%,the similarity of the simulative encoded amino acid with tryptophan halogenase(CP001848) was also reached up to 74%,and it proved that the cloned gene fragment was halogenase gene fragment,and these had laid a foundation for the follow-up function analysis of the gene.

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期刊信息
  • 《微生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省科学技术委员会
  • 主办单位:中国微生物学会 辽宁省微生物学会 辽宁省微生物科学研究院
  • 主编:张忠泽
  • 地址:辽宁省朝阳市双塔区龙山街四段820号
  • 邮编:122000
  • 邮箱:lnwswxh@126.com
  • 电话:0421-2914613 2976840
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-7021
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1186/Q
  • 邮发代号:8-142
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊,中国生物学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:11311