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中华按蚊防御素基因cDNA序列和基因组序列的克隆及鉴定
  • ISSN号:1000-7423
  • 期刊名称:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R384.111[医药卫生—医学寄生虫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]南方医科大学公共卫生与热带医学学院病原生物学系,广州510515
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.30271162),广州市科技计划项目(2001-001-J-01)
中文摘要:

目的 克隆中华按蚊防御素基因全长cDNA序列及基因组序列,并对其进行鉴定和生物信息学分析。方法 根据已发表的埃及伊蚊和冈比亚按蚊等的防御素基因序列设计引物,提取中华按蚊总RNA并构建其基因组文库,分别进行多轮RT-PCR和巢式PCR扩增,将所得片段进行克隆、测序,并应用相关生物信息学软件对序列进行鉴定和分析。结果 从中华按蚊基因组文库中扩增出完整的防御素基因组序列(由两个外显子和一个内含子组成)以及5’端和3’端的非编码序列(UTR)片段,总长度为2256bp;从中华按蚊总RNA中扩增出大小为324bp的cDNA片段,经测序证实为中华按蚊防御素基因全长cDNA序列,其开放阅读框共编码107个氨基酸,成熟肽部分具有40个氨基酸残基。结论 首次克隆出中华按蚊防御素基因全长cDNA序列及基因组序列,为进一步的功能研究奠定了基础。

英文摘要:

Objective To clone and identify the cDNA sequence and genomic DNA sequence of Anopheles sinensis defensin gene. Methods Referring to the published defensin gene sequences of Aedes aegypti and Anopheles gambiae, pairs of primers were designed to amplify the cDNA sequence and genomic DNA sequence of Anopheles sinensis defensin gene with template of Anopheles sinensis total RNA by RT-PCR and genomic DNA by nested PCR, respectively. These amplified fractions were cloned and sequenced, and were further identified and analyzed by relevant bioinformatics softwares. Results Complete genomic DNA sequence was cloned, including 5' and 3' UTR fraction and two exons separated by a 85 bp intron. Besides, the whole cDNA sequence of Anopheles sinensis defensin gene with 324 bp was also cloned, and its ORF encoded 107 amino acids. The mature peptide had 40 amino acids residues. Conclusion The whole cDNA sequence and complete genomic DNA sequence of the defensin gene of Anopheles sinensis have been cloned and identified for the first time.

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期刊信息
  • 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
  • 主编:汤林华
  • 地址:上海市瑞金二路207号右楼3F
  • 邮编:200025
  • 邮箱:zgjsczz@vip.163.net
  • 电话:021-54562376
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7423
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1248/R
  • 邮发代号:4-362
  • 获奖情况:
  • 1997年被中华预防医学会评为先进编辑部,2000年荣获中华预防医学会系列杂志优秀期刊一等奖,2001年荣获中华预防医学会2001年优秀期刊二等奖,2003年荣获2001-2002年中华预防医学会系列杂志优...,2009年获“百种中国杰出学术期刊”奖,2010年荣获上海市科技期刊审计优秀奖,2011年遴选为第二届“中国精品科技期刊”,获第三届“RCCSE中国权威学术期刊”,2013年荣获国家卫生计生委首届优秀期刊,2013年荣获第四届华东地区优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11792