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基于cpDNAatpB-rbcL非编码序列分析桫椤种群遗传结构和遗传多样性,以贵州赤水桫椤国家级自然保护区为例
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]广州卫生学校,广州510450, [2]广州医学院卫生职业技术学院,广州510450, [3]萍乡高等专科学校,萍乡337000, [4]中山大学,广州510275
  • 相关基金:本研究由国家自然科学基金资助项目(30771763,30170101)资助
中文摘要:

以PCR产物克隆后测序的方法测定了贵州赤水桫椤国家级自然保护区3个种群59个个体的叶绿体DNA(cpDNA)atpB—rbcL非编码区序列。序列长度介于727~732bp之间,具长度多态性,A+T百分比含量较高,介于63.27%~63.89%之间。遗传多样性水平较低,表现出较高的单倍型多样(h=0.639)和低的核苷酸多样性(Dij=0.00028)并存的特征,提示现有种群可能源自一个有效群体规模较小的种群的快速扩张,扩张时间尚短,不足以形成更为复杂的遗传结构。种群间的高基因流Nm、低遗传分化度峙、AMOVA分析以及DNA歧异度结果一致显示各种群间无明显的遗传分化。

英文摘要:

Chloroplast DNA (cpDNA) atpB-rbcL noncoding sequence of Alsophila spodophylla, collected from three populations distributed at Asphole National Nature Reserve in Chishui of Guizhou province were sequenced. Sequence length varied from 726-732 bp, showing length polymorphism, with high A+T content between 63.27% and 63.89%. High level ofhaplotype diversity (h=0.639) and a low nucleotide diversity (Dij=0.000 28) were detected in the populations of A lsophila spinulosa. This suggested rapid demographic expansion from a small effective population, and, since then, there has been insufficient time to form a more complicated population structure. Observed high gene flow Nm, low FST, AMOVA analysis and DNA divergence data consistently indicated that no genetic differentiation should occur at the population level.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299