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刺槐实时定量PCR分析中内参基因的选择
  • ISSN号:1001-7488
  • 期刊名称:林业科学
  • 时间:2014.9.15
  • 页码:167-172
  • 分类:S718.46[农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083, [2]北京风沙源育苗中心,北京102115, [3]福建省三明市国有林场管理处,三明365000, [4]福建省宁化国有林场,宁化365413, [5]中国林业科学研究院经济林研究开发中心,郑州450003
  • 相关基金:国家自然科学基金项目“刺槐杂交结实率低的机理研究”(31170629);国家科技支撑项目“抗逆生态树种刺槐新品种选育技术研究”(2012BAD0180601);北京市科委项目“首都平原百万亩造林科技支撑工程”(Z121100008512002).
  • 相关项目:刺槐杂交结实率低的机理研究
中文摘要:

实时荧光定量PCR 是由美国Applied Biosystems 公司于1996年在传统的PCR 技术基础上发展起来的一种新的核酸定量技术( Mackay,2004),具有定量准确、灵敏度高、特异性强、重复性好及高通量等优点(Huggett et al.,2005),已成为医学、农学、林学、微生物学等众多领域中进行基因表达和转录组分析的常用技术之一( Postollec et al.,2011;袁亚男等,2008)。

英文摘要:

The real-time PCR is an important method for analyzing gene expression levels. Selection of reference genes suitable for calibration of the expression of objective gene according to specific experimental materials and conditions is a prerequisite for obtaining reliable RT-PCR results. In this study,we used different individuals and different organs of black locust(Robinia pseudoacacia)to test the stability of six internal genes such as Actin gene (ACT),18S ribosomal RNA (18S rRNA),adenosylmethionine decarboxylase gene (SAMDC),helicase gene (Helicase),elongation factor gene (EF1-α),glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase gene (GAPDH) in the real-time PCR. After being analyzed with Genorm and NormFinder,the results showed that the ACT and 18S rRNA gene were the most stable genes by using different plant individuals as experimental material,while the ACT and GAPDH were the most stable genes with using different tissues and organs. Since some controversies existed with the 18S rRNA as reference gene,the both ACT and GAPDH used for reference gene in various test conditions obtained more accurate results. This study has important implications in obtaining a more accurate result of quantitative expression of black locust.

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期刊信息
  • 《林业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国林学会
  • 主编:尹伟伦
  • 地址:北京万寿山后中国林学会
  • 邮编:100091
  • 邮箱:lykx@vip.sina.com
  • 电话:010-62889820
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7488
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1908/S
  • 邮发代号:82-6
  • 获奖情况:
  • 在三届"国家期刊奖"评选中,两次荣获中国期刊最高奖-"国家期刊奖",一次名列"国家期刊奖提名奖"第一名
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:42472