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拟南芥Alpha-dioxygenase 2原核表达、纯化及亚细胞定位预测
  • ISSN号:1674-7968
  • 期刊名称:《农业生物技术学报》
  • 时间:0
  • 分类:S188[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌712100, [2]河南科技大学农学院,洛阳471003
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30300222)和西北农林科技大学优秀人才基金(No.042R009)资助.
中文摘要:

将拟南芥α-dioxygenase2(DOX2)基因编码区克隆到原核表达载体pGEX-5X-1获得重组表达载体pGEX-DOX2,转化至大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)pLysS和BL21(DE3)-RIPL codon+菌株中进行诱导表达。SDS-PAGE和Western blot结果表明,融合蛋白在BL21(DE3)-RIPL codon+中得到了高效表达,融合蛋白表观分子量约为98kD,占菌体总蛋白的38%。经GST亲和柱层析进一步纯化获得了可溶性重组蛋白;愈创木酚法测试表明,可溶性重组蛋白不具有过氧化物酶活性。利用Rare codon Caltor进行的密码子偏爱性分析显示,该基因读码框中含有88个大肠杆菌稀有密码子,占总密码子(631个)的14%;SignalP、CELLOv.2.5、PSLpred和Softberry-ProtComp Version6.1等软件分析结果显示,拟南芥DOX2可能定位于细胞质。

英文摘要:

The encoding sequence of Arabidopsis α-dioxygenase 2 (DOX2) gene was inserted into pGEX-5X-1 to obtain pGEX-DOX2. The recombinant vector was transformed into Escherichia. coli BL21 ( DE3 )pLysS and BL21 (DE3)-RIPL codon^+, respectively. A fusion protein about 98 kD was detected by SDS-PAGE and Western blot in the induced recombinant BL21 (DE3)-RIPL codon^+ strain, and it accounts for 38% of the total bacterial proteins. The target protein was purified by the GST chromatography column, and the peroxidase activity of the purified protein was tested using the guaiacol method, the result showed that the soluble fusion protein had no detectable peroxidase activity. Using rare codon Caltor software, 88 rare codons of E.coli were found in the DOX2 ORF. The subcellular localization analysis result predicted by Signal P, CELLO v.2.5, PSLpred and Softberry-ProtComp Version 6.1 indicated that the Arabidopsis DOX2 located in cytoplasm.

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期刊信息
  • 《农业生物技术学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:中国农业大学
  • 主编:武维华
  • 地址:北京市海淀区圆明园西路2号中国农大生命科学楼1053
  • 邮编:100193
  • 邮箱:nsjxb@cau.edu.cn
  • 电话:010-62733684 62731615
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-7968
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3342/S
  • 邮发代号:2-367
  • 获奖情况:
  • 在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010年)...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国乌利希期刊指南,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15081