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稀有变量关联分析中的泊松近似变阈值方法
  • ISSN号:0253-2778
  • 期刊名称:《中国科学技术大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O212.1[理学—概率论与数理统计;理学—数学]
  • 作者机构:[1]中国科学技术大学管理学院统计与金融系,安徽合肥230026
  • 相关基金:国家自然科学基金(11271346,11201452)资助
作者: 方红燕[1]
中文摘要:

稀有基因变量与疾病性状的关联性研究是全基因组关联分析的补充.然而,传统的关联分析检验方法不适用于稀有变量的检验问题,因此众多的针对稀有变量的新检验方法得以被提出和运用.变阈值方法是其中的一种方法,该方法相对于传统的关联分析检验方法在功效上有较大提高.这里从稀有事件的角度看待稀有变量突变等位基因的发生,以泊松近似分布代替二项分布,提出新的检验统计量,并在变阈值方法的基础上给出一个新的检验方法,即泊松近似变阈值方法.模拟试验结果表明该方法比变阈值方法有一致更高的检验功效,筛选变量的效率也得到了提高.

英文摘要:

The association study of rare genetic variants and disease traits as a supplement of genome-wide association study(GWAS)has achieved remarkable development and application.But the traditional association testing methods are not suitable for the rare variants association problem.Many new testing methods designed specifically for the rare variants have been proposed and applied.The variable-threshold(VT)method is one of them,which has achieved more power than the traditional association test methods.Here the occurrence of the mutation of rare variants was treated as a rare event.Poisson distribution was taken instead of binomial distribution and a new test statistic was proposed.Base on the VT method,a new test method was proposed,namely,the Poisson approximation variable threshold method(PAVT).Simulation results show that the new method has more power than VT method uniformly,and variant selection is more efficient.

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期刊信息
  • 《中国科学技术大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学技术大学
  • 主编:何多慧
  • 地址:安徽省合肥市金寨路96号
  • 邮编:230026
  • 邮箱:JUST@USTC.EDU.CN
  • 电话:0551-63601961 63607694
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2778
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1054/N
  • 邮发代号:26-31
  • 获奖情况:
  • 1999年,全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优...,2001年,安徽省1999-2001年度优秀科技期刊一等奖,2002年,第三届华东地区优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:8237