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登革2型病毒中国株3’非编码区RNA元件对翻译的影响
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:《微生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q933.985[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]军事医学科学院微生物流行病研究所,病原微生物生物安全国家重点实验室,北京100071
  • 相关基金:国家自然科学基金(30600530;30770107)
中文摘要:

【目的】探讨登革病毒(dengue virus,DEN)3’非编码区(untranslated region,UTR)RNA元件(VR、RCS2、CS2、CS1和SL)对基因组翻译的影响。【方法】首先构建登革2’型病毒中国株(DEN2.43)UTR与萤火虫荧光素酶基因(LUC)组成的病毒诱导报告基因(virus induced reporter gene,VIRG),在此基础上分别构建包含DEN2-433’UTR不同RNA元件的VIRG,并通过LUC检测、实时RT-PCR和Western blot方法分析含有不同元件VIRG对翻译效率的影响。【结果】发现完整的3’UTR缺失可显著抑制翻译,含有病毒VR元件VIRG的翻译水平与完整3’UTR的VIRG相似,RCS2或CS2元件可提高VIRG的翻译效率,CS1或SL元件可降低VIRG的翻译效率。【结论】DEN2-43病毒基因组3’UTR参与了报告基因的翻译,其不同元件具有可上调和下调报告基因翻译效率的作用。

英文摘要:

[Objective] To investigate the effect of the well-defined RNA elements (VR, RCS2, CS2, CSI and SL) within the 3'untranslated region (UTR) on dengue virus (DEN) translation. [Methods] We constructed a virus induced reporter gene (VIRG) by inserting the firefly luciferase (LUC) gene between 5'- and 3'-UTRs of DEN2-43 genome. Subsequently, a series of modified VIRGs consisting of different RNA elements in the 3'UTR were constructed. A 3'UTR-deficient VIRG was also constructed. The translational efficiency of all VIRGs was then analyzed by LUC detection, real time RT-PCR and Western blot assays. [Results] The translation of 3'UTR-deficient VIRG was abolished. The translational efficiency of VIRG with RNA element VR was comparable with that of VIRG with unmodified 3'UTR. The translational efficiency of VIRG with RNA elements RCS2 or CS2 was significantly higher while the translational efficiency of VIRG with RNA elements CS1 or SL was substantially lower than that of VIRG with RNA element VR. [Conclusion] These results suggested that 3'UTR was indispensable for DEN translation, and some RNA elements within 3'UTR might either up-regulate or down- regulate translation.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879