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用于高灵敏可视化检测松材线虫的闭管等温扩增法
  • ISSN号:1005-7021
  • 期刊名称:《微生物学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.95[生物学—微生物学] S432.45[农业科学—植物病理学;农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]南京医科大学基础医学院,江苏南京210009, [2]华东医学生物技术研究所,江苏南京210002, [3]南京军区南京总医院药理科,江苏南京210002
  • 相关基金:国家重大科技专项(2013zx10004103);国家科技转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08012-005);国家自然科学基金青年科学基金(21005088)
中文摘要:

建立了一种基于环介导等温核酸扩增技术(LAMP)的松材线虫高灵敏可视化闭管检测方法。针对松材线虫核糖体 DNA 的序列保守区域设计 LAMP 引物,通过优化 LAMP 体系中的 Mg2+、甜菜碱浓度和反应温度等因素,建立了环介导等温扩增法;并结合蜡封反应管对产物进行检测,检测结果可直接通过肉眼观察 SYBR Green I 荧光显色进行判定。结果表明,本方法可检测到低至10拷贝/管的松材线虫核酸片段,可对单条线虫进行检测,并且具有很高的特异性,能区分检测松材线虫与拟松材线虫。由于整个反应恒温进行,无需热循环仪;闭管检测极大地降低了扩增产物交叉污染的风险;检测速度快,整个检测过程只需40 min,为松材线虫的现场快速筛检提供了一种简便、高灵敏、高特异的工具。

英文摘要:

A visualized closed-tube loop-mediated isothermal amplification(LAMP)assay with high sensitivity meth-od to detect pine wood nematode(Bursaphelenchus xylophilus)was established. LAMP primers were designed aiming at the conservative domain of ribosomal DNA sequence of B. xylophilus through an optimization of LAMP reaction con-ditions such as concentration of Mg2 + ,betaine,and reaction temperature etc and established the LAMP method. The results of determination was observed through naked eyes by judging color changes of fluorescent coloration SYBR Green I of the product sealed with wax at the bottom of the detection tube. The results indicated that the sensitivity of the proposed method was as low as 10 copies of genomic DNA fragment of B. xylophilus,and it was sensitive enough to detect a single nematode. The method had a very high specificity,and could easily distinguish B. xylophilus from B. mucronatus. Because the whole reaction was carried out in constant temperature,no thermal cycler was needed. The closed-tube LAMP reaction greatly decreased the risk of cross-contamination from amplified products. The assay was very fast,it needed only 40 minutes for the whole detection process. Therefore,the established method provided a simple,highly sensitive and highly specific tool for rapid screening of pine wood nematode on the site.

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期刊信息
  • 《微生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省科学技术委员会
  • 主办单位:中国微生物学会 辽宁省微生物学会 辽宁省微生物科学研究院
  • 主编:张忠泽
  • 地址:辽宁省朝阳市双塔区龙山街四段820号
  • 邮编:122000
  • 邮箱:lnwswxh@126.com
  • 电话:0421-2914613 2976840
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-7021
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1186/Q
  • 邮发代号:8-142
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊,中国生物学核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:11311