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草莓属植物SCoT分析体系的建立及优化
  • ISSN号:1009-9980
  • 期刊名称:果树学报
  • 时间:0
  • 页码:393-397
  • 分类:S668.4[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]西南大学园艺园林学院,重庆北碚400715, [2]山西农业大学园艺学院,山西太谷030801, [3]沈阳农业大学园艺学院,沈阳110161
  • 相关基金:国家自然科学基金(30971976)
  • 相关项目:草莓十倍体和十二倍体种质创新研究
中文摘要:

为利用SCoT技术开展草莓属(Fragaria)植物种质资源遗传多样性及分子系统学研究,以草莓属植物11个野生种和1个栽培品种为试材,采用L25(5^6)正交试验设计,建立了草莓属植物的最优SCoT-PCR反应体系,即20μL反应体系中,含Mg^2+ 2.0mmol·L^-1、dNTPs 0.3mmol·L^-1、Taq酶0.75U、引物0.75μmol·L^-1、模板DNA40ng,并对退火温度进行了优化.对电泳检测方法及草莓属植物DNA提取方法进行了改进。共筛选出22个适于进行草莓属植物SCoT分析的引物。经验证,该反应体系稳定性好、可重复性强、多态性高、扩增效果好,适于草莓属植物的SCoT分析。

英文摘要:

Start Codon Targeted Polymorphism (SCOT) is a novel gene-targeted molecular marker tech- nique. In this experiment, a L25 (5^6) or thogonal design was used for the optimal SCoT-PCR reaction system of strawberry with 11 Fragaria species and a cultivar as materials. The optimal PCR reaction mixture of SCoT-PCR system for strawberry was 2.0 mmol·L^-1 Mg^2+,0.3 mmol·L^-1 dNTPs,0.75 U Taq polymerase, 0.75 μmol·L^-1 primer and 40 ng template DNA in 20 μL mixtures. Furthermore, the annealing temperature of each primer was optimized; the methods of electrophoresis and strawberry DNA extracting were improved. 22 primers were selected which were suitable to the SCoT-PCR reactions. The optimal reaction system with high polymorphism, stability and repeatability was obtained.

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期刊信息
  • 《果树学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院郑州果树研究所
  • 主编:王志强
  • 地址:河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
  • 邮编:450009
  • 邮箱:chinagsxb@163.con
  • 电话:0371-65330928 653387308
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-9980
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1308/S
  • 邮发代号:36-93
  • 获奖情况:
  • 获河南省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18699