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缺血再灌注脊髓损伤不同时序变化转录组学与表达调控网络构建的生物信息学分析
  • 项目名称:缺血再灌注脊髓损伤不同时序变化转录组学与表达调控网络构建的生物信息学分析
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81350013
  • 申请代码:H0910
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2014-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:杨小玉
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:吉林大学
  • 批准年度:2013
中文摘要:

本课题将以“缺血再灌注(I/R)脊髓损伤后蛋白质不同时序变化特点为切入点”,基于以往研究的基础上拟采用转录组学分析方法,对其阶段I/R动态演进过程中涉及到的多基因、多通路的变化及其相互作用关系进行比较研究,希翼能够系统地揭示I/R脊髓发生发展的动态变化本质。本研究整合全基因组表达芯片和miRNA表达芯片等方法,对12-24h时序变化I/R脊髓损伤与正常配对样本进行差异基因分析,按照I/R演进的时间序列分析miRNA差异表达谱。综合采用生物信息学方法,分析转录水平的miRNA-mRNA的蛋白基因表达关系,研究结果将对于阐明I/R动态转录组学变化规律提供重要证据,具有重要的理论价值和现实意义。

结论摘要:

英文主题词spinal cord;ischemia reperfusion injury;bioinformatics;transcriptome;Gene chip


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