中文摘要：

分子标记在遗传育种中起着至关重要的作用，对分子辅助育种尤其重要。然而由于大量物种缺乏基因组序列的信息，使得大量物种在种间或种内缺乏分子标记，因此阻碍了此物种的遗传育种的进程。本项目通过生物信息学的方法比较已有基因组的物种的序列，从而发现具有高度保守的同源序列，并在此基础上开发跨多植物物种的保守序列间隔区多态性（CSSP）标记。利用现有的11个物种的基因组序列，我们成功地开发了1,318对CSSP标记。通过设计其中50对标记的引物，我们对这些潜在的CSSP标记进行实验检验其种间与种内的多态性情况，结果表明92%的标记具有明显的扩增产物，而且具有多态性。通过比较不同物种的多态性，其中35对(70%)标记在物种间存在多态性，另外9对（18%）存在种内的多态性。并且，我们对潜在的CSSP标记，实验结果开发了一个小型数据，便于育种科学家方便检索。总之，我们开发的分子标记对遗传育种提供了一种有用的资源，并对于了解重要基因和保守序列进化也提供了一个很好的工具。