红树植物一直是生态学和进化植物学以及众多相关学科研究中的一个典型类群。由于生长在特殊的海滩环境,大部分红树具有胎萌、气根、支柱根、耐盐或抗盐等适应特征。对大多数红树植物(尤其是真红树类群)所具有的趋同特征的起源与进化进行深入研究,必须有效地利用来自更多分类群及更多分子证据的信息,同时也需要引入超树技术这一新的系统发育分析方法论工具。本研究以世界红树植物及其相关类群的核糖体、线粒体和叶绿体三个基因组的序列作为分子指标,整合自行测定的和基于生物信息学分析获得的序列,结合已有的形态学研究结果,应用多种超树技术,构建红树植物系统发育关系及进化式样;应用最大似然方法,检验红树植物超树中分子进化速率的异质性,探讨红树胎萌等趋同特征与分子水平适应性进化的相关性;针对趋同进化研究中的疑难问题,发展新的统计模型和计算程序,为今后开展"生命之树"研究提供一个有效的分析技术平台。