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BAC克隆高通量测序及短序列拼接方法的研究
  • 项目名称:BAC克隆高通量测序及短序列拼接方法的研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:31372573
  • 申请代码:C1908
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2014-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:康晓军
  • 依托单位:中国地质大学(武汉)
  • 批准年度:2013
中文摘要:

本研究以草鱼基因组BAC文库为材料,采用三维混合池策略,进行BAC克隆的高效率、高通量测序;通过计算机算法实现,从混合池中解析各个BAC克隆的短序列数据集。基于计算机图论理论,建立单个BAC克隆短序列数据集的精确拼接方法。运用这一方法,对草鱼BAC文库中的特定克隆进行测序和拼接,填补草鱼基因组框架图中的断裂区域。本研究将提供一种化繁为简的基因组测序及组装新思路,具有广泛的应用前景。

结论摘要:

英文主题词three-dimensional mixing pool;high-throughput sequencing;short sequence assembly;grass carp genomic;


成果综合统计
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