本研究以草鱼基因组BAC文库为材料,采用三维混合池策略,进行BAC克隆的高效率、高通量测序;通过计算机算法实现,从混合池中解析各个BAC克隆的短序列数据集。基于计算机图论理论,建立单个BAC克隆短序列数据集的精确拼接方法。运用这一方法,对草鱼BAC文库中的特定克隆进行测序和拼接,填补草鱼基因组框架图中的断裂区域。本研究将提供一种化繁为简的基因组测序及组装新思路,具有广泛的应用前景。
英文主题词three-dimensional mixing pool;high-throughput sequencing;short sequence assembly;grass carp genomic;