中文摘要：

本项目将采用国际上先进的核DNA标记（微卫星DNA）和线粒体DNA标记（mtDNA控制区）技术测定中国境内菊头蝠科蝙蝠基因序列，在分子水平上探讨菊头蝠科蝙蝠遗传多样性、分类地位、分布格局、亲缘关系和进化过程，为确定生物保护中的基本单元- - 进化显著单元和管理单元提供最直接的依据；在国内外率先构建中国境内菊头蝠科蝙蝠完整的分子系统树，预期获得一个较自然的菊头蝠科分类系统，并以此推断菊头蝠科的起源时

结论摘要：

本项目采用先进的线粒体DNA分子标记技术测定控制区和cytb基因序列，在分子水平上探讨了马铁菊头蝠、菲菊头蝠分类地位及群体遗传结构和多样性；菊头蝠科蝙蝠控制区基因变异模式及物种间系统发育关系，得出结论吉林地区的马铁菊头蝠为日本亚种，云南地区的可能为尼泊尔亚种，两地区马铁菊头蝠遗传分化水平较高；菲菊头蝠与单角菊头蝠、角菊头蝠mtDNA cytb和控制区序列分歧处于种内分歧水平，可能为同一物种，菲菊头蝠物种遗传多样性丰富，江西、四川和云南地区的菲菊头蝠群体刚刚发生分化，均未形成单系；菊头蝠科蝙蝠控制区基因结构同其他哺乳动物类似，划分为三个结构域- - ETAS、CD和CSB，还检测到ETAS1、ETAS2、CSB1、CSB2、CSB3、CSB1-like保守元件。在CSB区内存在拷贝数不同、重复元件不同的串联重复序列；控制区基因可以作为菊头蝠属内系统发育的分子标记，利用该基因获得的系统发育结果与形态学和cytb的结果一致。同时分析了大蹄蝠控制区结构及江西、云南和重庆群体的遗传结构和多样性水平，利用cytb基因，探讨了鼠耳蝠属物种在其科内的系统发育地位，对物种的保护和进化研究提供了有利证据。