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鲤科多倍化鱼类HOX基因簇演化研究
  • 项目名称:鲤科多倍化鱼类HOX基因簇演化研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30870291
  • 申请代码:C040204
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:罗静
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:云南大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

基因组加倍是驱动脊椎动物进化的重要动力之一。本研究选取脊椎动物中存在最频繁多倍化的鲃系四个亚科共17个属23种,采用HOX 基因簇等7个基因作为分子标记,结合鲤科鱼类线粒体基因组数据,对鲤科鲃系鱼类多倍化起源模式、起源时间及基因演化状况进行了研究。主要结果为现生鲤亚科鱼类的共同祖先作为一个母本,和与它的分歧约为4.69-6.40 MYA的姐妹关系的父本,于 10.71-12.42 MYA间杂交发生了异源多倍化,并逐步演化为现生的鲤亚科;在异源多倍化基础上,鲫属指名复合种欧亚不同群体间广泛存在近期进一步多次独立同源多倍化,更增加了基因组复杂度;野鲮亚科为单系并未经历多倍化并在鲃系中最早分化出来;鲃亚科中的中国结鱼发生异源多倍化;HOX基因簇结果显示多倍化物种存在高比例的假基因,同一个体同一基因不同拷贝间存在较大插入或缺失,选择压力差异明显;部分裂腹鱼类核型实验结果表现出染色体数与基因组大小存在正相关性,多倍化程度可能与其特化等级无关,而与其分布地区的地质变化剧烈程度相关。除已登记的成果外(3篇SCI,1章英文专著和1篇核心期刊),本项目仍有2篇SCI文章在审稿中,1篇已成文待投稿中。

结论摘要:

英文主题词the series Barbini; whole genome duplication or polyploidization; HOX gene cluster; pseudogenes


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 9
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
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