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利用连锁不平衡法发掘水稻种质资源群体的优异基因研究
  • 项目名称:利用连锁不平衡法发掘水稻种质资源群体的优异基因研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30700494
  • 申请代码:C130401
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2008-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:李金泉
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:华南农业大学
  • 批准年度:2007
中文摘要:

关联定位已成为发掘种质资源群体中优异基因的重要方法。本项目围绕原计划开展三个方面的研究,主要结果有1、构建一个含有150份水稻材料的核心种质群体,占原始资源群体的6.6%,该群体能够最大限度地保存原群体的遗传多样性;2、获得150份水稻核心种质群体的群体结构和连锁不平衡结构。利用STRUCTURE和PCoA分析发现,150份核心种质可划分为2个亚群(SG 1和SG 2),SG 1又可以进一步分为四个亚亚群。无论是整个核心种质群体,还是两个亚群、四个亚亚群,LD都在10-20cM区域显著衰减。有显著LD的block数量在11(SG 2)到56(整个核心种质群体)之间变化;3、发现一批新的和已报道的位点与12个产量及农艺性状显著关联。其中28个位点在08与09年均与目标性状显著关联,其中6个已报道过。与抽穗期显著关联的标记RM60遗传效应最小,为0.6%,与结实率显著关联的标记RM241遗传效应最大,为10.3%。已发表论文3篇,提交会议摘要2篇。

结论摘要:

英文主题词rice; core collection;population structure;linkage disequilibrium;association mapping


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 2
  • 0
  • 0
  • 0
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