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中华猕猴桃矮型基因的EST-SSR分析及其遗传基础
  • 项目名称:中华猕猴桃矮型基因的EST-SSR分析及其遗传基础
  • 项目类别:地区科学基金项目
  • 批准号:30660113
  • 申请代码:C1501
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:徐小彪
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:江西农业大学
  • 批准年度:2006
中文摘要:

从NCBI数据库中的猕猴桃EST中,随机抽取56,400条序列,应用SSRHunter软件查找SSR重复序列。结果表明,从猕猴桃EST序列中获得了7939条SSR,其中包括二核苷酸重复5131条(64.63%),三核苷酸重复1237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%), 六核苷酸重复890条(11.21%)。利用设计合成的6对引物在DNA测序仪上对猕猴桃种质的多态性进行了PCR检测,结果表明,该6对引物在两个亲本与矮型猕猴桃和普通型猕猴桃F1个体间均能清晰产生多态性分离。用EST-SSR分子标记技术结合BSA分析,并对亲本和F1分离群体进行验证,共筛选了85对EST-SSR引物,发现了其中一个与中华猕猴桃矮型基因Ad连锁的EST-SSR标记(EST-Ad042),其片段大小为285bp。通过EST-SSR分子标记,采用MAPMAKER/EXE 3.0软件对其分子标记的分离数据进行连锁分析,利用Kosamli函数将重组值转化为遗传图距(cM),构建出目标基因的局部分子连锁图,EST-SSR标记与Ad基因的遗传距离为8.8cM。

结论摘要:

英文主题词Kiwifruit (Actinidia), Dwarfing gene; EST-SSR marker; BSA; Genetic analysis


成果综合统计
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