病毒诱导的基因沉默(VIGS)是一种快速高效的研究植物基因功能的工具,传统VIGS通常被认为通过多种混合siRNA起作用,因而该技术有一个显著的局限可能导致非特异的基因沉默。microRNA是另一种可负调控基因表达的小RNA分子。通过过表达人工设计的microRNA基因有可能克服基因沉默的潜在非特异性;此外大量的植物内源microRNA已被鉴定和预测,但大多数功能不清楚;研究植物内源microRNA的功能的重要方法之一是过表达这些microRNA基因,目前过表达主要是通过植物转基因来实现的,而植物转基因耗时费力,在一些植物上极其困难。本研究拟利用植物DNA病毒发展病毒载体,并探索用病毒载体进行microRNA介导的基因沉默的可行性,一旦成功,将为快速特异地沉默特定基因和快速研究植物microRNA的功能提供新的工具。
miRNA在各种生物中的各类生物过程中都扮演着非常重要的角色。植物中的多个miRNA已经通过实验或者生物信息学的方法得到鉴定和预测。然而,由于缺少有效的遗传学研究工具,这些miRNA的功能大多都是未知的,因此,开发能快速有效研究miRNA功能的遗传学工具的需求就变得非常紧迫。我们在本课题的支持下首先开发了一个基于卷心菜卷叶双生病毒(Calcrv)载体,该载体既可用于在植物中表达内源miRNA,也可用于表达人工miRNA。我们运用该基于病毒的miRNA表达系统(MIR VIGS),证明了通过表达人工miRNA可以非常有效的在本生烟草中沉默PDS,Su,CLA1,和SGT1等基因。沉默SGT1导致了N基因介导的对TMV抗性的丢失。此外,我们还利用MIR VIGS系统异源过表达了miR156和miR165, 均产生了发育不正常的表型。异源过表达miR165还可诱导烟草叶片产生黄斑。由此,我们开发的MIR VIGS系统不仅可以用来沉默代谢和抗性相关的基因,也可以用于研究植物内源的miRNA。其次,我们对烟草脆裂病毒(TRV)进行改造构建了一个用来在植物中异源过表达RNA的载体。我们利用该载体表达miRNA的靶标模拟序列来沉默植物内源miRNA,并将该系统命名为病毒介导的miRNA沉默系统(VbMS)。在烟草中我们利用VbMS系统成功沉默了miR165/166和miR172,都出现了发育表型。而利用VbMS在番茄中沉默miR319使其复叶复杂度降低。以上结果表明,基于TRV的VbMS系统是一个功能强大的在植物中用于研究miRNA功能的工具。