中文摘要：

利用叶绿体微卫星（cpSSR）、线粒体nad1基因以及核基因组表达序列标签微卫星（Expressed Sequnce Tag Microsatellites，EST-SSR）三类分子标记，研究巴山松的居群遗传多样性水平，分析巴山松的居群遗传结构、地理分化；揭示巴山松不同遗传体系的基因组织方式、进化规律；探讨巴山松不同基因组的亲本来源、演化历程以及对大巴山区特殊生境的适应性进化；确立巴山松与其近缘种

结论摘要：

本项目从居群水平出发，利用叶绿体微卫星、线粒体nad1、matR、nad5、19S基因和核基因组AFLP分子标记，从三个基因组角度研究了巴山松及其近缘种（油松、云南松、黄山松、马尾松）系统发育关系，结果证实巴山松在分类学上应作为独立种处理，而不是前人所认为的是油松或马尾松变种。在起源上巴山松与黄山松有密切的亲缘关系，可能是祖先种在大巴山和大别山等不同地理区域发生分化的结果，而油松与二者关系稍远。研究同时表明，松属植物不同基因组进化速率差异大，基因组组成与进化规律复杂。线粒体基因在几种松树中进化速率低，序列高度一致，这与其他松树的研究并不相同；叶绿微卫星显示五种松树都拥有特定的系统树分枝，并有部分的基因共享；而AFLP结果则揭示了五种松树核基因组相似性高，仅占据三个不同系统分枝，可能是它们分化较晚或者是长期相互基因交流的结果。