位置:立项数据库 > 立项详情页
天蓝色链霉菌线型质粒SCP1的复制与接合转移
  • 项目名称:天蓝色链霉菌线型质粒SCP1的复制与接合转移
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31100063
  • 申请代码:C010301
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2014-12-31
  • 项目负责人:张冉
  • 依托单位:中国科学院上海生命科学研究院
  • 批准年度:2011
中文摘要:

链霉菌属于高GC含量、产生菌丝体和孢子的革兰氏阳性细菌。在链霉菌的不同种中发现了约6600种抗生素和药理活性代谢物,约占全部微生物天然药物的一半。前人在模式菌- - 天蓝色链霉菌的巨大线型质粒SCP1上鉴定了1个复制区,我们近期的工作显示SCP1上存在3个不同的复制区。本项目拟在遗传和生物化学水平上精细分析这3个复制区,包括鉴定最小复制功能区、复制基因的转录起点、复制蛋白与非编码DNA序列的相互作用。通过连续敲除1个和2个复制区,以及在SCP1不同位置进行人工环化,获得的突变体与天然SCP1比较在遗传的稳定性和拷贝数方面的变化。鉴定SCP1上参与质粒稳定分配和接合转移相关的基因。在此基础上,尝试利用SCP1发展大片段DNA克隆和转移系统。

结论摘要:

前人的研究鉴定了天蓝色链霉菌质粒SCP1上一段5.4kb区域为复制区,而我们的研究则显示SCP1上含有3个复制区域。在该研究中,我们将前人鉴定的5.4kb的复制区减小为3.2kb,同时鉴定了两个新的复制区,其中所包含的两个复制蛋白rep2A和rep3A与链霉菌质粒pZL12的复制蛋白相似,然后对这三个复制蛋白的转录起点进行了鉴定。通过研究发现,这三个复制区均能够以线型的形式在链霉菌中进行独立复制。rep1A和rep3A能够被单敲除和连续敲除,敲除rep1A或者rep3A的SCP1能够在天蓝色链霉菌中进行增殖,并且拷贝数基本没有变化,同时其遗传稳定性和接合转移效率与SCP1基本相同。我们将SCP1进行人工环化,得到一个280kb的环型SCP1,命名为C-SCP1,C-SCP1包含了3个复制区。对C-SCP1的拷贝数,稳定性及接合转移效率进行测定,发现C-SCP1的这些性状与线型SCP1是相似的。同时,选取菌株的各个生长状态,测定线型SCP1和环型C-SCP1中rep1A,rep2A和rep3A基因转录的情况。同时以同源重组为基础,通过“加减法”将 81kb的阿维菌素生物合成基因簇及76kb的多杀菌素生物合成基因簇克隆到质粒SCP1上,并且在宿主菌中检测到了异源表达的阿维菌素,成功建立了大片段DNA克隆系统。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 0
  • 0
  • 0
  • 0
相关项目
期刊论文 18 著作 1
期刊论文 20 会议论文 8
张冉的项目