棉花是改良利用盐碱地的先锋作物。目前在耐盐碱转基因分子育种中所应用的基因大多是能够编码蛋白质的结构基因,在基因的转录水平起调控作用。miRNA是近年来发现的一类不能编码蛋白质的、单链小分子RNA,能够在基因的转录后水平调控下游靶基因的表达。因此,研究miRNA应答盐胁迫的调控机制有望为耐盐碱转基因分子育种提供新型基因。本项目在前期研究中发现盐胁迫下miRNA在棉花耐盐品系和盐敏感品系中存在显著差异,并通过调控靶基因的表达应答盐胁迫,由此说明miRNA参与了棉花的耐盐调控过程。本项目在前期研究的基础上,拟构建盐胁迫下棉花根系的小RNA文库,利用棉花全基因组序列,在全基因组水平筛选与盐胁迫相关的棉花miRNA;利用生物信息学结合降解组测序鉴定miRNA所调控的下游靶基因,从而建立棉花通过miRNA表达参与调控盐胁迫的代谢途径,为棉花耐盐碱转基因分子育种提供功能明确的新型基因。
英文主题词Cotton;Salt stress;miRNA;Target gene;ARF