信号传导是分子生物学中的重要方向,涉及细细胞分化、细胞生长、细胞形态等,影响着细胞的绝大部分功能。信号传导过程中运用了各种方式的分子相互作用,包括蛋白蛋白相互作用,磷酸化,蛋白核酸相互作用,蛋白小分子作用等,而蛋白与细胞膜的结合是其中一种重要方式,这一类结合在相当多的信号传导通路中被使用,特别是对脂质调控以及蛋白的亚细胞定位起着决定性作用。在蛋白组水平上准确预测生物膜的结合特性才能建立正确的蛋白相互作用网络,进而研究信号传导和开发药物新靶点。由于实验测量上的困难和以往计算方法的缺乏,迫切需要对在这一领域进行研究。本课题针对细胞膜表面的信号传导,结合我们最近提出的膜与蛋白双重识别结构域的新概念,拟进行以下几个方面研究在蛋白相互作用家族中预测与细胞膜结合的蛋白结构域;运用数据挖掘进行蛋白细胞膜相互作用的关键因子的预测;运用分子动力学研究结合模式;整合蛋白细胞膜结合数据研究相互作用机理。
英文主题词signal transduction;membrane binding;subcellular localization;structure prediction;function prediction