泛素及相关修饰蛋白超家族在细胞凋亡、代谢调节、蛋白监控、免疫应答、信号传递、转录控制、DNA修复等一系列生命活动中均发挥着重要作用。在执行本项目的一年时间内,我们整合泛素及相关修饰蛋白超家族的序列、结构和功能信息,应用二级结构组份的对位排列、祖先结构的最大简约估计和进化关系的最大似然重建等一系列生物信息技术,发展新的氨基酸置换模型和统计算法,对泛素超家族成员进行了进化分类分析。在此基础上,对新鉴定的家族及成员进行功能预测及初步实验验证,为开展复杂蛋白超家族的结构与功能分析提供了新的生物信息技术平台。此外,应用本项目成果开展了哺乳动物CAII基因的进化分析,一篇论文已在《科学通报》发表。
英文主题词Ubiquitin, protein modifier, evolutionary classification, functional prediction; experimental verification