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泛素蛋白超家族的进化分类、功能预测与实验验证
  • 项目名称:泛素蛋白超家族的进化分类、功能预测与实验验证
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30971641
  • 申请代码:C0607
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2010-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:王莉
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:上海生物信息技术研究中心
  • 批准年度:2009
中文摘要:

泛素及相关修饰蛋白超家族在细胞凋亡、代谢调节、蛋白监控、免疫应答、信号传递、转录控制、DNA修复等一系列生命活动中均发挥着重要作用。在执行本项目的一年时间内,我们整合泛素及相关修饰蛋白超家族的序列、结构和功能信息,应用二级结构组份的对位排列、祖先结构的最大简约估计和进化关系的最大似然重建等一系列生物信息技术,发展新的氨基酸置换模型和统计算法,对泛素超家族成员进行了进化分类分析。在此基础上,对新鉴定的家族及成员进行功能预测及初步实验验证,为开展复杂蛋白超家族的结构与功能分析提供了新的生物信息技术平台。此外,应用本项目成果开展了哺乳动物CAII基因的进化分析,一篇论文已在《科学通报》发表。

结论摘要:

英文主题词Ubiquitin, protein modifier, evolutionary classification, functional prediction; experimental verification


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 2
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