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中国汉族人群先天性脊柱侧凸TBX6候选基因多态性与相关蛋白质学研究
  • 项目名称:中国汉族人群先天性脊柱侧凸TBX6候选基因多态性与相关蛋白质学研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81171673
  • 申请代码:H0601
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2012-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:仉建国
  • 依托单位:中国医学科学院北京协和医院
  • 批准年度:2011
中文摘要:

先天性脊柱侧凸(Congenital scoliosis,CS) 是一种高致残率、高死亡率的小儿脊柱畸形之一,其确切病因不清。相当多证据已经证明CS是一种多基因遗传病,我们在上一个国家自然科学基金项目资助下(批准号: 30672137)研究发现并确证了TBX6基因多态性与中国汉族人群CS遗传易感性具有高度关联,引发并锁定TBX6基因作为候选基因展开CS发病机制的研究设想。本研究拟通过比较携带TBX6候选基因的CS患者30例和对照组血清标本30例、通过CyDye染料交叉标记双向电泳,筛选出2倍上调表达的差异蛋白、然后进行质谱分析鉴定、基因多态性验证(RT-PCR/ PCR,HRM 和Taq-Man)分析,以期在蛋白质水平阐述候选基因TBX6可能具有CS遗传易感性关联的致病作用,完善与发病机制具有关联的病因学假说。最终从蛋白质水平阐述中国汉族人群CS的发病机制,为其诊断和防治提供科学证据。

结论摘要:

按照项目的研究计划,课题组首先对中国汉族人群先天性脊柱侧凸患者的基因异常进行研究。通过对166例散发先天性脊柱侧凸患者与正常人群的对照研究,我们发现有17例患者存在TBX6的无义突变。通过家系研究发现单纯的TBX6无义突变并不能导致先天性脊柱侧凸发病。进一步我们发现TBX6亚效等位基因与TBX6无义突变联合作用可导致部分CS的发生。相关研究成果发表在New England Journal of Medicine 杂志。 课题组使用比较蛋白质组学研究方法对15例CS患者以及正常对照的血清蛋白质进行研究,发现先天性性脊柱侧凸患者和对照组血清中有155个蛋白质差异点,两者之间的差异有统计学意义。其中62个点在CS血清中表达上调,93个点表达下调。. 蛋白质差异点经质谱分析,IPI-HUMAN数据库鉴定出16个差异蛋白。相关研究结果在课题组孙武博士毕业论文中发表。在血清蛋白质组学研究实验过程以及结果分析中课题组发现血清蛋白质易受其他因素干扰,故而进一步选择间充质干细胞为CS患者与正常人群蛋白质组学对比研究的研究对象。课题组收集并建立了30例CS患者骨髓间充质干细胞标本库。课题组对5例先天性脊柱侧凸患者以及5例年龄、性别匹配的正常对照人群的骨髓间充质干细胞进行蛋白质组学对比研究。实验主要采用反向色谱分离及LC-MS 质谱分析方法进行蛋白质鉴定,选择差异显著(P<0.05)的蛋白质结果报告。研究发现先天性脊柱侧凸患者同正常对照相比共鉴定出210个差异蛋白,其中上调的蛋白质有61个,下调的有149个。 课题组还使用miRNA芯片技术首次对CS患者与正常人群的血清miRNA进行了对比研究。实验分别使用3例分节障碍型、3例形成障碍型CS患者与正常对照进行对比研究。本研究首次对CS患者进行血清miRNA微阵列芯片研究,发现CS患者的血清miRNA与正常人存在差异,并成功构建了CS患者与正常对照组患者血清差异miRNA资料库。研究发现分节障碍型先天性脊柱侧凸患者同正常对照相比上调的miRNA有 54个,下调的有42个;形成障碍型先天性脊柱侧凸患者同正常对照组相比上调的miRNA 有19个,下调的有28个。相关研究成果在课题组博士王升儒博士毕业论文中发表。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 5
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