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鲢、鳙中高密度遗传连锁图谱的研究
  • 项目名称:鲢、鳙中高密度遗传连锁图谱的研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30771643
  • 申请代码:C190201
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2008-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:童金苟
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院水生生物研究所
  • 批准年度:2007
中文摘要:

在鲢、鳙中筛选了一批AFLP和微卫星(SSR)标记。利用其中1666 AFLPs和101 SSRs标记,进行鲢、鳙杂交亲本及88个F1子代的基因型分析。利用符合孟德尔1:1分离的1253 AFLPs和83 SSRs构建了鲢、鳙遗传图谱。 鲢图谱有24个连锁群(LGs),包含658 AFLPs和40 SSRs,总图距1742 cM,平均标记间距2.49 cM;鳙图谱有25个LGs,包含595 AFLPs和43 SSRs,总图距1826.7 cM,平均标记间距2.86 cM。鲢、鳙图谱较为接近鲢/鳙单倍体染色体数(n=24)。利用鲢、鳙图谱中相同的 SSR作锚定位点,15个鲢LGs与14个鳙LGs有同源关系,与其他作者的5个鲢LGs和4个鳙LGs也有同源关系。利用已定位SSR的侧翼序列与模式鱼类基因组作保守共线性比对,鲢鳙基因组与斑马鱼有46.7%同源性,与绿河豚只有6.4%同源性。本遗传图谱的总图距和分辨率高于其他学者发表的鲢、鳙图谱,为鲢、鳙基因组结构和功能及比较基因组研究提供了新的架构。为更好地研究鲢、鳙基因组特性及应用基因组研究,有必要构建SSR或SNP标记第二代鲢、鳙遗传图谱。

结论摘要:

英文主题词Silver carp(Hypophthalmichthys molitrix); bighead carp(Aristichthys nobilis); genetic linkage map; AFLP; microsatellite (SSR)


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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  • 3
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