中文摘要：

通过开展本项研究，率先在世界上开发出莲SSR分子标记，开发出的引物数目也最多；利用该标记，进行了莲10个品种SSR标记指纹图谱构建，品系纯度鉴定，筛选出"莲藕基因组计划"测序所用的理想材料；开展了莲种质资源遗传多样性及遗传分化研究，结果表明国内栽培种与地理分布无明显相关性，而与表型性状有关；中国莲与国外莲可能与地理隔离有关；子莲群体比藕莲群体有更高的遗传多样性。EST-SSRs标记分析，结果类似栽培种和野生种之间、子莲品种和藕莲品种之间，存在遗传分化。证明基因组-SSR比EST-SSR能检测到更多的遗传变异。首次构建了中国莲和美洲黄莲叶绿体全基因组图谱，分别为163,307 bp和163,206 bp，叶绿体基因组含有130个基因，其中不同的基因113个4个rRNA基因、30个tRNA基因、79个编码蛋白质基因。基因组中有398个SNP位点、161个indel位点。中国莲中NTS长354bp，美洲黄莲为358bp，差异在于中国莲缺失了一ATGA四碱基序列。并用"FIASCO法"成功对茭白、芋头、芡实、水芹等4种水生蔬菜作物进行了SSR引物的开发，证明该法具有重要的推广应用价值。