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染色质修饰的分子机理研究
  • 项目名称:染色质修饰的分子机理研究
  • 项目类别:海外及港澳学者合作研究基金
  • 批准号:31028013
  • 申请代码:C0606
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2012-12-31
  • 项目负责人:张毅
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:中国科学院生物物理研究所
  • 批准年度:2010
中文摘要:

申请人多年来一直致力于表观遗传学的分子机理研究,在组蛋白的共价修饰及其生物学功能研究领域取得了一系列的成绩。代表性工作包括1)发现了EZH2-EED/PRC2,hDot1L,Set7,Set8, ESET等一系列重要组蛋白赖氨酸甲基转移酶,阐明了其生化机制,揭示了PRC2和hDot1L等甲基转移酶在发育和重大疾病中的作用;2)发现了包括Bmi1-Ring1A/B的PRC1复合物的组蛋白泛素化酶活性以及这个复合物在HOX基因转录调控及X染色体失活中的功能;3)发现了首个JMJC家族的组蛋白去赖氨酸甲基化酶,随之发现了包括首个去三甲基化酶在内的一系列JMJC家族成员,并揭示了它们的重要生物学功能;4)揭示了Elongator复合物在DNA去甲基化中的重要作用。这一系列的工作得到了国际上的普遍认同,2008年被ScienceWatch评为生命科学领域最有影响的前十名作者。

结论摘要:

本项目选取染色质修饰中的DNA甲基化修饰为主要研究内容,通过结构生物学手段研究DNA去甲基化的修饰及识别。在DNA去甲基化催化反应的结构生物学研究中,选取DNA胞嘧啶5-甲基羟化酶Tet1-3开展结构与功能研究。完成了Tet1、Tet2和Tet3蛋白催化结构域及CXXC结构域几十种不同片段的基因构建及蛋白质表达纯化工作。2)选取其中性质较好的片段,检测了它们与DNA、甲基化的DNA以及羟甲基化DNA的结合能力。3)尝试了Tet1和Tet3蛋白催化域片段及其与底物复合物(甲基化的DNA及2-OG)以及CXXC结构域与DNA复合物的结晶筛选工作。由于Tet蛋白分子量大,表达纯化困难,性质不稳定,很难结晶,项目后期又选取了锥虫中的同源蛋白JBP进行的结构研究,其中JBP2的C端截短体可以得到性质较好的蛋白,正在进行结晶筛选;在Tet催化产生的羟甲基化及羧甲基化DNA识别的结构机理研究中,选取了多个潜在的优先结合羟甲基化或羧甲基化DNA的蛋白质。表达纯化这些蛋白并与相应的羟甲基化或羧甲基化DNA共结晶,解析其三维晶体结构。我们成功的解析了RPA1蛋白与包含2个5-caC的单链DNA复合体的晶体结构。并通过进一步的结构分析及功能实验,研究RPA1特异识别羧化修饰的胞嘧啶的结构机理及生物学意义。此部分工作正在整理发表中。

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