中文摘要：

黑领噪鹛（Garrulax pectoralis）和小黑领噪鹛（Garrulax monileger）是两个多型种，各亚种的地理分布存在平行分化。本项目用比较谱系地理的方法，研究这种平行分化的分子基础，分析这两种鸟各亚种间的遗传差异、基因流和种群扩散方向，结合形态学测量数据和野外生态观察数据解释地质历史事件、气候环境对亚种地理分布格局形成以及物种演化的影响；分析黑领噪鹛和小黑领噪鹛亚种演化的模式和进化过程、并且比较它们之间的异同；探讨中国南方及周边地区在更新世冰期是否存在生物的避难所以及这种避难所对现今该地区鸟类多样性形成的影响。本项目的研究成果可以加深对我国鸟类起源和进化知识的了解，丰富了物种进化的理论，对阐明我国南方及周边地区鸟类多样性丰富的原因、制定鸟类保护措施起着指导作用。

结论摘要：

项目执行时间从2012年1月1日始到2015年12月31日止，主要工作及结果如下（1）到广东、广西、海南、湖南、云南和贵州开展组织样本的收集及鸟类调查。分别发现了湖南省鸟类新记录红交嘴雀（Loxia curvirostra）和贵州鸟类新记录大草莺（Graminicola bengalensis）；（2）在海南、云南和广东的天然林和人工林开展了鸟类群落研究，发现了华南地区优势鸟种画眉科鸟类在人工林中数量稀少，提醒在人工林经营管理过程中，要保留灌丛植物的重要性。也关注了电子污染物对鸟类群落组成与结构的影响，对全球濒危鸟类海南鳽（Gorsachius magnificus）的繁殖生态进行了研究；（3）开展了鸟类血液寄生虫与鸟类的协同进化研究；（4）开展了红胁蓝尾鸲（Tarsiger cyanurus）的分子谱系地理研究；（5）黑领噪鹛与小黑领噪鹛平行演化的结果1）对来自于21个地点的72个样本进行了基因测序。共使用了8个基因，其中线粒体基因3个和5个核基因；2）从遗传多样性看，黑领噪鹛四个亚种的排列次序是华南亚种>海南亚种>滇南亚种>指名亚种；小黑领噪鹛四个亚种的排列次序是华南亚种>海南亚种>广西亚种>指名亚种；两个物种的同域分布亚种变化规律一致；3）从谱系结构看，两个物种分类清晰，同域分布的相应亚种；4）从遗传距离看，两个物种均是指名亚种与其它亚种的遗传差距远远大于其它三个亚种间的遗传距离，两种鸟的指名亚种与其它亚种间均没有共享单倍型，遗传距离较远、缺乏基因流，建议作为独立的种处理，成为G. pectoralis and G. monileger；5）华南地区是两种鸟类的冰期避难所，地质历史事件是影响两个种种群遗传分化的主要动力。所以，从遗传多样性、谱系结构、遗传距离和基因流方面均显示黑领噪鹛和小黑领噪鹛亚种分化是平行的，支持了形态上的结论。共标注基金项目编号的论文13篇，其中SCI 7篇、中文核心5篇、英文文章1篇。四年期间共25人次参加学术会议，培养研究生8名、其中博士生1名、硕士生7名，所有财务报帐完全按国家相关规定执行，没有违规现象，经费略有结余。