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基于商空间理论的蛋白质相互作用研究
  • 项目名称:基于商空间理论的蛋白质相互作用研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:61203290
  • 申请代码:F030504
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:杜秀全
  • 依托单位:安徽大学
  • 批准年度:2012
中文摘要:

蛋白质是生命体的主要基本物质,对蛋白质相互作用的深入研究不仅有助于理解细胞喝生物通路的功能变化,而且理解这些相互作用对各种疾病的发病机理和治疗具有积极的推进作用。目前存在大量的方法从不同的角度分析和预测蛋白质相互作用,但精度依然比较低。本研究引进一种新的理论分析方法,以公共数据库中的蛋白质相互作用数据为基础,利用商空间理论中的保假原理和保真原理将原始问题粒度化,再分别对各商空间下的预测模型采用粒度合成方法进行结果合成,最后将构造的商空间模型应用于蛋白质相互作用网络的构建。探讨不同特征下的蛋白质相互作用界面残基特性,设计一种新的覆盖聚类算法进行蛋白质相互作用位点的识别,并建立相应的网络在线预测系统,为生物学家进行相关的实验研究提供方向参考。

结论摘要:

英文主题词protein-protein interaction;quotient space model;feature selection;multi-instance;driver mutation


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
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  • 3
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