免疫分子间的相互作用是实现免疫调控的基本步骤,这种识别与作用是受物理化学规律控制的。本项目针对免疫分子相互作用开展了定量研究。主要进展为(1)发展了一系列可用于免疫分子结构模拟、相互作用计算与设计和生物网络模拟的方法,主要包括免疫蛋白质多个表面环区的计算方法,蛋白质-蛋白质相互作用的定量计算方法,蛋白质-配体分子对接方法,并针对HIV胞内感染过程进行了生物网络模型研究;(2)建立了可用于免疫相关分子间相互作用的热力学及动力学过程研究实验平台,可以定量测定免疫分子间结合的平衡常数和动力学常数;(3)针对TNF等体系利用自行发展的蛋白质功能嫁接方法进行了功能蛋白质设计,找到了一些经突变改造后可以与TNF结合的蛋白质;(4)与重大项目内的其它课题组合作开展了肿瘤相关抗原肽的设计以及pMHC-TCR体系的模拟等。在本项目的支持下,已发表SCI收录论文20篇。培养博士研究生5人、硕士研究生2人、博士后3人。