生物信息学及计算生物学研究正在从序列分析转向以系统生物学的观点研究生物调控的基本规律,这种多学科交叉研究的趋势蕴育着重大的突破。本项目的重点是选择特定的生物学网络,研究生物网络调控的理论,探索及发展基于调控网络的药物设计方法。包括(1)生物分子间相互作用规律研究及分子对接方法研究;(2)重要代谢网络及信号传导网络的拓扑结构及动力学特性研究;(3)针对花生四烯酸代谢网络进行网络拓扑结构及动力学分析,在此基础分析网络关键作用结点及网络调控规律,研究各种抑制剂对于网络的影响;(4)针对花生四烯酸代谢网络开展相应的实验研究。
生物网络研究对于认识生物调控机理具有重要意义。本项目的重点是选择特定的生物学网络,研究生物网络调控的理论,探索及发展基于调控网络的药物设计方法。经过三年的努力,完成了原订计划任务。发展了区分蛋白质-蛋白质结合真假界面的综合打分方法,研究了动力学因素对于蛋白质-蛋白质结合的影响;针对花生四烯酸代谢网络开展了研究,建立了相关的网络模型,进行了网络动力学模拟计算并对加药前后网络的动力学行为进行了比较,开展了相应的定量实验;发展了针对生物网络的多药靶标分析和基于网络的药物设计方法。 项目执行三年已发表SCI论文12篇。课题参加人出席国际会议16次,做特邀报告13次,分组报告3次。