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耐辐射球菌irrE增强大肠杆菌抗逆性的分子机制研究
  • 项目名称:耐辐射球菌irrE增强大肠杆菌抗逆性的分子机制研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30970069
  • 申请代码:C010301
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2010-01-01-2012-12-31
  • 项目负责人:陈明
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国农业科学院生物技术研究所
  • 批准年度:2009
中文摘要:

分离克隆可供植物基因工程利用的新基因,研究其耐盐抗旱分子机制是当今转基因植物研究开发和竞争的热点。我们发现耐辐射基因irrE能赋予大肠杆菌及油菜、烟草极高的耐盐能力(达350mM NaCl),是一类可开发的抗逆性基因资源。由于细菌和植物存在对各种胁迫应答相当接近的机制,为进一步研究抗逆分子机制,本项目以模式菌株大肠杆菌为研究对象,主要针对大肠杆菌胁迫反应的全局转录因子RpoS,甘油、海藻糖渗透保护物质的代谢途径,开展irrE基因对上述基因的转录表达调控的研究。拟通过RT-PCR分析在胁迫条件下与抗逆相关代谢途径的基因转录水平,利用凝胶阻滞电泳或构建共转化系统,分析调控蛋白IrrE与相关基因及转录因子启动子序列的相互作用。探讨和阐明IrrE对这些抗逆基因的调控机制。本项目开展耐辐射基因对大肠杆菌抗逆分子机制的研究,为培育抗逆转基因作物提供新的基因资源及开拓新的途径。

结论摘要:

前期研究工作我们发现来自耐辐射异常球菌全局调控蛋白IrrE 能赋予大肠杆菌及油菜、烟草极高的耐盐能力,调控蛋白参与各种胁迫反应中基因调控表达和信号传导,其分子机制并不清楚。本研究以模式菌株大肠杆菌为研究对象,发现IrrE能增强大肠杆菌UV辐射、盐、高渗透、高温等逆境胁迫抗性,蛋白结构分析、截短实验、位点突变实验表明IrrE蛋白的锌依赖型多肽酶、HTH和GAF3个结构域是维持IrrE调控蛋白功能所必需的,IrrE 184位点是UV辐射抗性的关键位点。凝胶阻滞试验显示His-Tag IrrE融合蛋白能非特异结合各种参与胁迫反应相关基因的启动子区序列。转录组学和蛋白质组学数据分析结果表明IrrE参与了细胞核苷酸代谢、碳源代谢、氨基酸代谢、膜上转运载体、氧化还原酶等300多个代谢功能基因的表达调控。此外,多达14个转录调控因子的表达差异,appY, evgA, gadE, gadW, gadX, yhiF 和asnC表达显著上调,betI, cynR, mhpR, prpR, tdcA, kdgR和purR的表达显著下调。导致了细胞内核苷酸合成、碳源利用、氨基酸代谢、细胞内氧化还原酶以及细胞酸抗性调控系统等代谢发生明显改变。推测IrrE作为全局调控蛋白,通过对这些转录因子的调控,转录级联放大反应促进或抑制基因表达,发挥全局调控的作用,整体增强了细胞的抗逆作用。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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