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基于细菌16S rRNA为靶标的抗生素筛选模型
  • 项目名称:基于细菌16S rRNA为靶标的抗生素筛选模型
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30371703
  • 申请代码:H3003
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2004-01-01-2006-12-31
  • 项目负责人:吴根福
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:浙江大学
  • 批准年度:2003
中文摘要:

随着细菌抗药性的不断增强和新型致病菌的不断出现,对新抗生素的需求也日益强烈。新抗生素的发现有赖于新型筛选模型的建立。本申请旨在建立一个以16S rRNA(16S rDNA)及其保守序列为靶标的高效筛选模型。拟选择2-3个有代表性的致病细菌菌株,以27F,1492R为引物,PCR扩增其全序列16S rDNA,以此为靶标,从海洋微生物或稀有放线菌中筛选能特异地与该靶标结合的专性抗生素;比较致病细菌的16S rRNA序列,人工合成其中的保守片段(长20- - 30bp),并将它固定到载体上,以此保守片段为靶标,筛选能与其特异结合的广谱抗菌药物。由于16S rRNA与16S rDNA的负链相似,因此筛得的药物除可影响核糖体的功能外,还有可能与DNA结合干扰复制和转录。而且这些保守序列相当稳定,因靶位点突变而产生的抗药性几乎不大可能发生。

结论摘要:

随着抗生素的广泛使用,微生物的抗药性也逐渐增强,而人类免疫力的不断下降,使新的致病菌和条件致病菌不断出现,为此必须加大力度,建立新的抗生素筛选模型,开发新的抗生素。建立了一个以核糖体RNA的保守序列为靶标的高效筛选模型。通过比较致病细菌的 rRNA序列,人工合成其中的保守片段,并将它固定到载体上,以此保守片段为靶标,筛选能与其特异结合的广谱抗菌药物;或将靶标直接加到发酵浓缩物中,让靶标在液相中与抗菌药物"杂交",然后分离杂交物,来筛选抗菌药物。用已知的相关抗生素进行实验,证明该模型是可行的,但用该模型从微生物发酵液中钓取抗生素的研究尚未成功。 从海洋微生物及土壤微生物中分离到一批细菌和放线菌(包括稀有放线菌)菌株,对这些菌株进行了鉴定。对抑菌效果较好以及抗生素产生报道较少的菌株进行较大规模的发酵实验和抑菌确证试验。发现其中的一株AP19-1菌株,其发酵代谢产物具有对所有5株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(菌株号B3892,B8208,B6172,B6189,B4524)强烈的抑制作用,对藤黄微球菌、枯草芽孢杆菌、短小芽孢杆菌等也有明显的抑菌效果。对该化合物的结构鉴定尚在进行中。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
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