本项目提出并拟建立一种简单灵敏的基于表面等离子体共振(SPR)技术进行单核苷酸多态性(SNPs)分型的新方法。含无碱基位点(AP site)的探针ss-DNA与目标基因杂交形成ds-DNA,该ds-DNA中目标碱基与其面对的AP site形成一个疏水的微腔,固定化的探针小分子嵌入该腔体并识别目标碱基,利用SPR 技术监测识别过程并实现SNPs的分型和定量测定。设计和合成能通过氢键识别碱基的探针小分子;研究探针小分子固定化方法;研究液相和固定化探针小分子与含AP site ds-DNA的相互作用及分子识别过程;测量识别过程的相关热力学和动力学参数;研制SPR-SNPs 新传感器件;建立性能优良的小分子探针SPR-SNPs分型传感新方法;探索探针小分子与含AP site 的ds-DNA识别的规律。该项目将为SNPs基础和应用研究提供器件和分析新方法,促进SPR、SNPs和生物传感器等的研究。
英文主题词single nucleobase polymorphisms, surface plasmon resonance, abasic site, small molecule, hydrogen bonding