中文摘要：

早期准确诊断和及时进行相应的治疗,对肿瘤患者生存期延长和生活质量的提高具有重要的意义。如何早发现早治疗，如何明了肿瘤的发生的机制，如何找到相关的预后标记，以防患于为然？如何识别哪些患者将发生复发转移、哪些患者会在化疗中受益一直是我们关注的重要问题。而肿瘤复发和转移的发生、发展涉及众多基因的变化，其过程相当复杂，目前尚无单一的指标能够预测肿瘤患者的预后。本课题组拟对有完整随访数据的乳腺癌/大肠癌组织标本开展全基因组表达谱、肿瘤基因组序列和结构性变异研究，同时针对筛选的候选基因进行选择剪切、等位基因不平衡表达研究。我们期望建立包括环境信息、组织标志物、表达谱特征群组、特定基因甲基化程度、选择性剪切及等位基因的的不平衡表达等所共同组成的遗传分子标志组数据库；并利用遗传分子标志组建立乳腺癌发生发展和大肠癌预后转归相关的学习模型。为指导乳腺癌/大肠癌个体化治疗提供一定的理论基础。

结论摘要：

如何明了肿瘤的发生的机制，如何识别哪些患者将发生复发转移、哪些患者会在治疗中受益一直是我们关注的重要问题。而肿瘤复发和转移的发生、发展涉及众多基因的变化，其过程相当复杂，目前尚无单一的指标能够预测肿瘤患者的预后。我们分别以乳腺癌和大肠癌为模型对肿瘤的发生发展和预后转归进行研究。 针对20对乳腺癌组织及8个细胞株我们开展了表达谱与SNP－CNV研究。发现552个基因在癌与癌旁中存在表达差异，其中440个基因下调，112基因上调；同时通过甲基化芯片初步筛选出80个在癌、癌旁组织中存在统计学差异甲基化基因，对从表达谱中筛选的候选基因根据其功能进行Gene Ontology (GO)分类，发现主要集中在hsa04060、hsa03320 、hsa00982 D、hsa04110 等通路。随后对其中10个差异显著基因（CRIM、FOLR1、MGC、ECRG4、APC、CD40、EPHA5、SOX17、RASSF1、DLK1）在扩大的样品中进行了相关研究。发现ECRG4, Sox17, EphA5 的表达水平与甲基化状态以及GPx3 的CNVs 与乳腺癌的发生、发展密切相关。 利用Illumina 平台针对49例大肠癌样品开展的全基因组表达谱检测，发现了20个预后转归相关基因在预后转归中存在表达差异的基因聚类分析显示其在训练组和验证组中PPV＝83.30% 和81.81%，矫正后整体PPV达到了90%；首次发现ATP2A2基因两个转录本的mRNA表达量的比值与大肠癌进展密切相关；利用DASL技术对95例结直肠癌研究，我们发现8个差异表达基因。将分析获得的基因表达指数与患者的TNM分期相结合后将患者分成高危、中危和低危组，生存曲线显示低危、中危和高危患者三年无复发生存率分别为92.3%、58.7%和30.4%。进一步，我们建立了通过高表达基因探针计数进行的预后分析方法，并申请了相关专利。 后续相关工作仍在开展中，随着时间推移和越来越多的数据的产生，必将为癌症的个体化诊疗提供帮助。