中文摘要：

以分子鉴定与传统的形态学相结合的分类方法为基础，整合分子系统学、生物信息学和生态学研究方法，通过对单殖吸虫中一些重要类群（指环虫目指环虫属、海盘虫属、鳞盘虫科）的有关物种形成模式的探索，以求在寄生虫的物种形成这一进化生物学重要理论问题上获得创新性的研究成果通过对淡水指环虫属的分子进化研究，探索寄生虫与宿主鱼类的协同进化关系，探讨指环虫的物种形成模式，通过生态及历史因素，分析指环虫属适应辐射的生物地理学成因；通过对寄生海水石斑鱼类的鳞盘虫类和海盘虫类单殖吸虫的分子进化研究，探索同一宿主寄生多种寄生虫以及单殖吸虫的广宿主性寄生的生物学机制；通过构建单殖吸虫分子进化研究的生物信息数据库，并在此基础上对各类群，各分类阶元展开分子进化研究，寻求适合单殖吸虫分子生物地理学研究的合适标准。

结论摘要：

本研究利用核糖体DNA序列对单殖吸虫几个重要类群（指环虫、海盘虫、鳞盘虫等）开展分子形态学及进化生物学分析，主要的成果包括（1）明确了几个单殖吸虫重要类群的分类学地位及其与近缘类群的系统学关系，如鳞盘虫科三个亚科的单系性及其相互关系；锚首虫亚科10个属的单系性及其相互关系问题等；（2）研究了海水鱼寄生海盘虫类及淡水鲤科鱼类寄生指环虫类的物种形成模式，发现前者同时存在"共进化"，"宿主转化"等多种物种形成模式，而本研究分析远缘鲤科鱼类寄生指环虫发现寄生虫和宿主之间存在明显的共进化关系，从而揭示了指环虫的早期起源问题；（3）利用分子系统学结果评价形态学分类依据的合理性问题，结果表明交接器结构特征与分子系统学分析有着较好的对应关系，可以用于今后建立新属及进行分类学研究的重要性状特征，而后吸器结构及几丁质阴道结构比较适合用于物种鉴定，在用于分析系统发育分析时，容易引入人为分类群；（4）本研究分析了单殖吸虫类现有DNA序列的变异情况，初步筛选出适合于单殖吸虫各阶元、各类群的DNA序列，并建立了单殖吸虫DNA序列专用数据库和查询、编辑工具。