将非线性随机动力学的理论和方法,特别是拟Hamilton系统随机平均法应用于DNA分子生命活动中动力学的研究,包括DNA的变性进展速率预测和DNA转录起点的识别。将环境的热作用以热噪声的形式引入到DNA分子的动力学模型,建立起描述DNA热变性活动的随机激励的耗散的Hamilton系统,将变性进展问题转化为系统能量或碱基对分离距离的首次穿越问题,得到变性进展时间或速率的预测,理论结果将与DNA变性动力学的实验结果相比较和分析,并进一步研究DNA碱基序列信息对变性速率的影响。跟踪研究采用计算机模拟的方法识别DNA转录的起点位置,在掌握模拟方法的基础上,将DNA碱基序列信息引入PBD模型,研究序列信息与DNA转录起点之间的关系,得到适当的理论方法,能够用概率的形式来识别DNA转录的起点位置。通过上述课题的研究,初步建立起一些适用于生物大分子随机动力学研究的理论和方法。
英文主题词DNA thermal denaturation; identification of DNA transcription start-site; nonlinear stochastic dynamics; quasi Hamiltonian system