位置:立项数据库 > 立项详情页
DNA热变性动力学和转录起点的识别
  • 项目名称:DNA热变性动力学和转录起点的识别
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:10802074
  • 申请代码:A020203
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:邓茂林
  • 负责人职称:副教授
  • 依托单位:浙江大学
  • 批准年度:2008
中文摘要:

将非线性随机动力学的理论和方法,特别是拟Hamilton系统随机平均法应用于DNA分子生命活动中动力学的研究,包括DNA的变性进展速率预测和DNA转录起点的识别。将环境的热作用以热噪声的形式引入到DNA分子的动力学模型,建立起描述DNA热变性活动的随机激励的耗散的Hamilton系统,将变性进展问题转化为系统能量或碱基对分离距离的首次穿越问题,得到变性进展时间或速率的预测,理论结果将与DNA变性动力学的实验结果相比较和分析,并进一步研究DNA碱基序列信息对变性速率的影响。跟踪研究采用计算机模拟的方法识别DNA转录的起点位置,在掌握模拟方法的基础上,将DNA碱基序列信息引入PBD模型,研究序列信息与DNA转录起点之间的关系,得到适当的理论方法,能够用概率的形式来识别DNA转录的起点位置。通过上述课题的研究,初步建立起一些适用于生物大分子随机动力学研究的理论和方法。

结论摘要:

英文主题词DNA thermal denaturation; identification of DNA transcription start-site; nonlinear stochastic dynamics; quasi Hamiltonian system


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 4
  • 2
  • 0
  • 0
  • 0
相关项目
邓茂林的项目