大肠癌是严重危害人类生命和健康的恶性肿瘤之一,虽然已经发现了与大肠癌发生相关的某些遗传学变化,但对大肠癌发展中最重要的侵袭和转移这两个过程的分子机理仍然所知甚少,因此寻找在大肠癌发展中扮演重要角色的基因,不仅对于阐明此过程的分子机理至关重要,而且是研发新一代有效治疗药物的关键。本课题在用基因芯片对大肠癌作全基因组表达后发现的一个在大肠癌特异性高表达基因片段的基础上,用生物信息学分析找到了此高表达片段代表的人类内源性逆转录病毒蛋白酶家族的三个成员,研究此三个基因的mRNA和蛋白质分子在肿瘤组织中的相对丰度,以及它们在不同阶段肿瘤组织中的表达和分布,进一步用SiRNA技术在细胞水平来研究它们的功能,从而阐明这些基因在大肠癌发生发展中的作用和地位,为探索新的治疗大肠癌的手段打下基础。
本课题调整后的研究内容包括两部分一个psiTPTE22-HERV相关基因的研究和一个结肠癌相关人内源性逆转录病毒(HERV)基因的研究。 psiTPTE22-HERV相关基因RT-PCR和克隆测序找到其三个转录产物,表达量高的两个含一长402nt的ORF,定量PCR检测发现含此ORF的mRNA在肾、肝、胃和肺的癌旁正常组织中高表达,而在相应的癌组织中低表达。由于该基因位于22号染色体靠近着丝点处,启动子区及第一个内含子区GC含量很高,通过DNA甲基化抑制剂和组蛋白去乙酰化酶抑制剂的处理,能使得不表达该基因的RKO等细胞重新表达该基因,从而证实该基因的表达可能受到DNA甲基化等表观遗传学的调控。结肠癌相关HERV基因在研究psiTPTE22-HERV的过程中在结肠癌组织中发现了一个HERV相关基因。经克隆测序获得了全长的含4个ORF的mRNA序列。定量PCR和原位杂交实验证实该基因在结肠癌组织中特异高表达,其表达与胃癌、肝癌和肾癌等不相关。启动子活性实验证实该基因的表达主要受细胞中存在的转录因子调控。两个基因蛋白的体外表达等工作还在进行中。